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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005237`

染色体: Chr01 坐标: 69935416-69935893 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005237`
名称	SmilChr01G005237
描述	auxin-responsive protein SAUR20-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69935416 - 69935893 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005567`
GeneID	`131005567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005567`
原始查询	`LOC131005567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-responsive protein SAUR20-like
产物	auxin-responsive protein SAUR20-like
Arabidopsis	`AT4G38840` (AT4G38840) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830039] identity=69.7; qcov=0.759; evalue=3.49e-32; confidence=medium
Rice	`Os08g0118500` (OsSAUR31) - identity=65.5; qcov=0.667; evalue=3.43e-20; confidence=low
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788559.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788559.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788559.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788559.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69935498`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B109,B131,B16,B25,B26,B4,B82,B90,C22,C82,D10
`Chr1:69935543`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B10,B109,B125,B131,B140,B16,B25,B26,B27,B32,B4,B82,B90,B92,C22,C82
`Chr1:69935544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C41,C69
`Chr1:69935564`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B38,B39,B64,B97,C13,D1,D3,D6
`Chr1:69935582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B84,C18,C41,C69
`Chr1:69935588`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	76	A13,A20,A21,A4,A8,A9,B1,B10,B101,B104,B108,B109,B111,B113,B119,B121,B122,B125,B127,B129,B130,B131,B133,B135,B136,B140,B16,B18,B2,B20,B25,B26,B27,B28,B32,B4,B40,B5,B50,B56,B57,B58,B6,B60,B63,B70,B79,B83,B84,B87,B90,B91,B92,B96,C12,C16,C18,C2,C22,C23,C3,C33,C37,C39,C4,C43,C44,C47,C48,C57,C8,C82,D11,D6,D7,D8
`Chr1:69935600`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A11,A20,B111,B121,C43,C8
`Chr1:69935616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:69935627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B121,B84,C43,C8
`Chr1:69935634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B93,B94,C15
`Chr1:69935638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C11,C41
`Chr1:69935651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788559.1

87 aa

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 9-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788559.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	9	83	3.1e-23	82.5	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932576.1
CAACACATTTCTCATCTTCAACCACCAAACAAGCAATTTAGTTTAATGTCTTCTTGAATTTGATTTCTTTCACAACTACCTGATATAAAGAAAATAAAAATCTCTAATTTCACTTACTTGATTTGTTCAACAATGGCCATCCGCCAAATGCTGAGACGGTCTTTATCCGGCGAGAGAAGGTCAGCTGAAGTAGTTCCAAAGGGGCATCTTGCTGTTTATGTTGGTGATAATGAAAAGAAGCGCTTTATTATTCCAGTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005567
ATGGCCATCCGCCAAATGCTGAGACGGTCTTTATCCGGCGAGAGAAGGTCAGCTGAAGTAGTTCCAAAGGGGCATCTTGCTGTTTATGTTGGTGATAATGAAAAGAAGCGCTTTATTATTCCAGTAGCGTACTTGAACCATCCCTCGTTTCAAGAGTTGTTGTTTCAAGCTGAGGAAGAGTTCGGTTTCAATCATCCGATGGGAGGCCTCACCATTCCTTGCAGTCAAGAATTATTTGTAGATTTCCTCTCTGGCTTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788559.1
MAIRQMLRRSLSGERRSAEVVPKGHLAVYVGDNEKKRFIIPVAYLNHPSFQELLFQAEEEFGFNHPMGGLTIPCSQELFVDFLSGFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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