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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005275`

染色体: Chr01 坐标: 70176878-70177697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005275`
名称	SmilChr01G005275
描述	30S ribosomal protein 3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70176878 - 70177697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005610`
GeneID	`131005610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005610`
原始查询	`LOC131005610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein 3, chloroplastic-like
产物	30S ribosomal protein 3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G15760` (PSRP3/2) Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831432] identity=54.8; qcov=0.829; evalue=3.14e-45; confidence=medium
Rice	`Os04g0461100` - identity=66.3; qcov=0.684; evalue=1.52e-44; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04839 (PSRP-3_Ycf65)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788602.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057788602.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788602.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788602.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70177119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B114,B138,B69,B88
`Chr1:70177226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B113,B133,B64,C30
`Chr1:70177278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B138,B16,C4,C69
`Chr1:70177368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B76,C4,C60,C69
`Chr1:70177427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B76,C4,C60
`Chr1:70177433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B33,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788602.1

152 aa

152

PSRP-3_Ycf65

PF04839 PSRP-3_Ycf65 102-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788602.1`	Pfam	`PF04839`	PSRP-3_Ycf65	Family	102	148	1.9e-25	89.6	Plastid and cyanobacterial ribosomal protein (PSRP-3 / Ycf65)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932619.1
CAACTTAATTTCAAAATAGATTCAACATTTCATCAAATTGTGAATAGATTCTAGAAAGCCCAAAGAAGAAATAATACCCCAGAAAACCAAGCGGGCCTAATAACTGGGCTTCGGGTTAACAGACGTCATCATTCATCACTTCCCAAAACAACAGGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGACCGCTATTCCCATTTCCGTTATCAGTTTCTCATTCTCGAGACTGCAATCCACGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGTTATCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005610
ATGTTATCAACATTTGGAATCGAAACATGTTGTTCACTAGTCCCAGCAAAAACACCTCAAATTGGAATCTCCCCCAAACCCCAAAACCCCTCAATTTGTTCATACCCAAACAAGAAACCCTTAACCATTCCATCCTCTTCCTCCGCCGCAACGCAGGCAATCGGAAATGAGGAGAGGGAGAAGATGAAGGTGGTGGTGAAGGCGATGGAGCGGCCGCGGCTGCTGCTCAAGTTCATCTGGATGGAGAAGAACATCGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788602.1
MLSTFGIETCCSLVPAKTPQIGISPKPQNPSICSYPNKKPLTIPSSSSAATQAIGNEEREKMKVVVKAMERPRLLLKFIWMEKNIGIAIDQLIPGGHGTIPVSPYYFWPRKDAWEELKLMIETKPWISQKQKVILLNQATDIINLWQQTGHS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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