当前解析结果
SmilChr01G005291| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005291 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005291 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005291 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 70231881 - 70234315 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005623 |
|---|---|
| GeneID | 131005623 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005623 |
| 原始查询 | LOC131005623 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005623 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788616.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057788616.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057788616.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788616.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788616.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:70232780 |
GTA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B117,B129,B140,C12,C28,C33,C46,C58,C84 |
Chr1:70232829 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B18,B6,B83,C39 |
Chr1:70232913 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B109,B26,B71,C31,C62,C84 |
Chr1:70232928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,B28,C78,C85 |
Chr1:70232955 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C78,C85 |
Chr1:70232972 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A21 |
Chr1:70232972 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr1:70233081 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B108,B53,B73,C23,C24,C34,C74 |
Chr1:70233102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B29,B87,D6 |
Chr1:70233125 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr1:70233140 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr1:70233206 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B48,B50 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。