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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005297`

染色体: Chr01 坐标: 70277189-70277889 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005297`
名称	SmilChr01G005297
描述	dirigent protein 21-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70277189 - 70277889 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005630`
GeneID	`131005630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005630`
原始查询	`LOC131005630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 21-like
产物	dirigent protein 21-like
Arabidopsis	`AT1G65870` (AT1G65870) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842898] identity=40.7; qcov=0.888; evalue=1.92e-38; confidence=medium
Rice	`Os11g0179400` - identity=45.7; qcov=0.803; evalue=9.26e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057788620.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788620.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788620.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788620.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70277239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C48
`Chr1:70277274`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A7,B12,B15,B19,B30,B42,B55,B80,B81,B99,C25,C70
`Chr1:70277330`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A7,B107,B108,B12,B125,B128,B14,B15,B19,B20,B21,B30,B40,B42,B43,B55,B61,B63,B76,B80,B81,B88,B93,B99,C10,C16,C25,C26,C41,C44,C60,C70,C80,D9
`Chr1:70277355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:70277462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:70277472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr1:70277492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B44,C20,C32,C68
`Chr1:70277533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:70277577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B54,C24,C64,C66
`Chr1:70277605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B36,B51,B79,C62
`Chr1:70277632`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A21,A7,A8,B102,B103,B104,B109,B118,B119,B123,B126,B17,B25,B26,B3,B31,B38,B39,B48,B50,B52,B58,B71,C1,C19,C31,C5,C53,C73,C80,D11,D2,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788620.1

188 aa

188

Dirigent

PF03018 Dirigent 48-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788620.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	48	186	5.5e-45	153.4	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932637.1
TACTACTACACTAAACACATAACCCATAAAACCCCCAAAAATGACGAAATCAACTTCAGCTTCCATTCTCTTACTCACCCTAATTTCCGCAATAACCCTAAACGACGTCGTTTCAGAAGGCCCGACGGAGCTCAAGAGCTGGTTCGAGATGATGAGCCGCGACAAACCGCCCGAGAAAATTACCAAATTGCACTTCTACTTCCATGATTTGGCCAAGGGCAAAAACGTAACTGCGGCCGTGGTGGCCCGATCCAACGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005630
ATGACGAAATCAACTTCAGCTTCCATTCTCTTACTCACCCTAATTTCCGCAATAACCCTAAACGACGTCGTTTCAGAAGGCCCGACGGAGCTCAAGAGCTGGTTCGAGATGATGAGCCGCGACAAACCGCCCGAGAAAATTACCAAATTGCACTTCTACTTCCATGATTTGGCCAAGGGCAAAAACGTAACTGCGGCCGTGGTGGCCCGATCCAACGTCACTTCTTTCGGGGTGCTTGCTTCGGCGGATGACCCGCTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788620.1
MTKSTSASILLLTLISAITLNDVVSEGPTELKSWFEMMSRDKPPEKITKLHFYFHDLAKGKNVTAAVVARSNVTSFGVLASADDPLTVRPELTSKRVGYLKGLYMTASFEEVDLLMAMTFVFTDETYNGSSLSVLGHNPHQHLYRELPVVGGSGRFRLARGVASLQTYFYNRTIGNAIVEVDIMVFHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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