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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005298`

染色体: Chr01 坐标: 70279934-70281517 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005298`
名称	SmilChr01G005298
描述	two-component response regulator ORR26-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70279934 - 70281517 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005631`
GeneID	`131005631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005631`
原始查询	`LOC131005631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ORR26-like
产物	two-component response regulator ORR26-like
Arabidopsis	`AT1G67710` (ARR11) response regulator 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843096] identity=69.4; qcov=1.05; evalue=6.8e-78; confidence=high
Rice	`Os01g0904700` (RR26) - identity=71.5; qcov=1.01; evalue=4.85e-90; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0003677 (DNA binding); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788621.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788621.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788621.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788621.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70280297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr1:70280313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B59
`Chr1:70280336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C26,C49
`Chr1:70280353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B15,B59,C49
`Chr1:70280431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr1:70280431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:70280435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:70280438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B71,B80,B96,C37
`Chr1:70280450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr1:70280467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:70280563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:70280565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788621.1

184 aa

184

Response_reg

Myb_DNA-binding

PF00072 Response_reg 1-57 aa PF00249 Myb_DNA-binding 128-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788621.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	1	57	4.8e-09	37.1	Response regulator receiver domain
`XP_057788621.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	128	178	6.1e-09	36.6	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932638.1
TGGTGTGTGTGATTGTGAAGATGTGCAATTCTTTGACCCATCAGGGAAACATGAGAAGGGGATATTAATCCAAAATGGTTTATGGATTAATTCTTCCTACAAGATGAGCAAACTTCTCTTTGGTTGTATGATTGCAGACATGGCTCGAAGAAGAAGTATTCTAAAATTCTATGCACTTGGAGAGGTCTAAAAAGAAGTTTTGAGTCTCCACCTTGAGGACAAGGTGGTTTTCGAAGAAGTCACAACGTGTAATTTGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005631
ATGCCAGACATGGATGGTTTCAAGCTTCTGGAGCACGTCGGCCTGGAGATGGATCTGCCCATGATAATGATATCCGTGGATGGGGAGACGAGCCGGGTGATGAAGGGGGTCCAGCACGGCGCCTGTGATTACCTTCTCAAGCCGATCAGGATGAAGGAGCTCCGCAACATATGGCAGCACGTGTTCAGGAAGAGGATACACGAGGTGAGGGACATTGAAGGCCACGAGAGCCTTGACGAGATGATGCTCAGAGGCGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788621.1
MPDMDGFKLLEHVGLEMDLPMIMISVDGETSRVMKGVQHGACDYLLKPIRMKELRNIWQHVFRKRIHEVRDIEGHESLDEMMLRGGADLSDDGFFFGGDPVSGKKRKDVDYKGDDRVGGDPSSLKKARVVWTVDLHQKFVKAVNLIGFEKVGPKKILDLMGVPWLTRENVASHLQKYRLYLSRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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