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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001466`

染色体: Chr01 坐标: 28453009-28456605 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001466`
名称	SmilChr01G001466
描述	uncharacterized SmilChr01G001466
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28453009 - 28456605 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005644`
GeneID	`131005644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005644`
原始查询	`LOC131005644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=31.2; qcov=0.693; evalue=1.51e-27; confidence=low
Rice	`Os11g0577650` - identity=55.6; qcov=0.627; evalue=1.87e-67; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788636.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057788636.1`
3	Telomere	端粒	0.80000	`XP_057788636.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788636.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28455653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr1:28455659`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B107,B119,B29,B85,C51
`Chr1:28455659`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B107,B119,B29,B85,C51
`Chr1:28455693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B77,C23
`Chr1:28455725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:28455796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C71
`Chr1:28455797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B42,B43,B90,B92
`Chr1:28455797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B90,B92
`Chr1:28455818`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	73	A15,A23,A6,A7,A8,B10,B100,B101,B102,B108,B11,B111,B113,B115,B124,B128,B13,B132,B134,B137,B14,B20,B23,B24,B26,B29,B3,B30,B33,B34,B38,B41,B49,B5,B53,B58,B6,B64,B7,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B81,B87,C12,C15,C18,C25,C32,C38,C4,C47,C48,C49,C5,C55,C58,C68,C70,C72,C73,C75,C76,C78,C86,D2,D3,D5,D8,D9
`Chr1:28455914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C82
`Chr1:28455914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:28455929`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	55	A1,A24,A5,A6,B10,B102,B11,B117,B119,B128,B129,B132,B18,B2,B21,B22,B27,B30,B4,B49,B51,B53,B55,B57,B59,B6,B63,B65,B83,B88,B94,B96,B97,C1,C10,C12,C13,C19,C35,C39,C4,C50,C51,C55,C56,C66,C67,C78,C82,C83,C84,C85,D3,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788636.1

287 aa

144

287

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 71-151 aa PF13359 DDE_Tnp_4 183-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788636.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	71	151	5.1e-24	84.7	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057788636.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	183	245	1.4e-07	32.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932653.1
ACAAGCAAAGGAAACCGCAGCCCACCCTCGGTTAGTTTTCACGGGCATCCCGCTTAGAATTAATTTTCCCTTTGATGCCCTCTTCGAAAACATCAAAAAAATCGAAAATAGATTGTGGCGCTCATTTTTCGTCTTCATTTCTTTCTCTCTGATACTGAAGTCAAGCTTTCTCTCCATTTTTTCGAAGATAATAACATCGGTATGCCGCCTCCACTTAAGCTGTCTGATAAGGACTATGTCTTCATAATACTACAAGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005644
ATGCCGCCTCCACTTAAGCTGTCTGATAAGGACTATGTCTTCATAATACTACAAGAGATAATGCGTCAACACATTCATCAATTGTTCATTGTATTCGAATGTATTGCTAACCATACAGCAAGAAAGAGAAAGCGCAATACGAATGTGGCTCCCTATCGAATCATTCCCCGAATCCCAGACCAAGTAAAACATTTGAATAGGATGGTGGCTGTAAGTGACATAGATTGCATAGTTAATCTGCGTATGGACCGCAATGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788636.1
MPPPLKLSDKDYVFIILQEIMRQHIHQLFIVFECIANHTARKRKRNTNVAPYRIIPRIPDQVKHLNRMVAVSDIDCIVNLRMDRNAFGRLCILLRQLGGLQDKRYVTVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFNFWRSGQTISHYIHVVLRAILRLHVILLVKPEPVPDDCTDSRWKWFKGCLGALDGTYINVTVSNMDKPRYRTRKGQISTNTLAVCDRNMKFAYVLPGWEGSAADSRILRDAVIGRDDISLAYLIFYENYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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