当前解析结果
SmilChr01G001470| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001470 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001470 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001470 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 28479235 - 28480794 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005654 |
|---|---|
| GeneID | 131005654 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005654 |
| 原始查询 | LOC131005654 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0671600; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os11g0671600; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os11g0671600- identity=46.1; qcov=0.841; evalue=8.62e-52; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005654 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788663.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057788663.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057788663.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788663.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788663.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:28480095 |
G |
GAC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A1,B2 |
Chr1:28480095 |
G |
GAC |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | A1,B2 |
Chr1:28480099 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C1,C17,C31,C4,C49 |
Chr1:28480103 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr1:28480111 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B46,C27,C43 |
Chr1:28480155 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr1:28480181 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr1:28480357 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A18,A7,B102,B134,B48,B64,C5 |
Chr1:28480385 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr1:28480393 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,D3 |
Chr1:28480437 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B66,C33,C47,C73 |
Chr1:28480438 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B101,B140,C28,C35,C67,C85,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。