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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005334`

染色体: Chr01 坐标: 70542168-70544089 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005334`
名称	SmilChr01G005334
描述	scarecrow-like protein 32
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70542168 - 70544089 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005661`
GeneID	`131005661`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005661`
原始查询	`LOC131005661`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 32
产物	scarecrow-like protein 32
Arabidopsis	`AT3G49950` (AT3G49950) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824157] identity=62.3; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0589200` - identity=63.1; qcov=0.944; evalue=2.31e-180; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005661

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788667.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788667.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057788667.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788667.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788667.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70542463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B32,B59,C37
`Chr1:70542502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,B86
`Chr1:70542520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B15
`Chr1:70542600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C67
`Chr1:70542620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B18,B2,C16
`Chr1:70542813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:70542838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:70542933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:70542951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:70543110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:70543121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B10,B139,C50,D1
`Chr1:70543133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A11,B103,B107,B108,B109,B129,B131,B16,B27,B47,B51,B55,B58,B70,C12,C28,C41,C48,C51,C53,C56,C59,C8,C81,C87,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788667.1

431 aa

216

431

GRAS

PF03514 GRAS 43-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788667.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	43	428	4.2e-96	322.8	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932684.1
TGATGTATAGATATAGCCCATGAGTAAGCCAAAGCAGAACTGCTTTCATTCCTTGAGCATTAAAGGACAAAATTCAACTCCCACATGCTTACAAATTCCCCTCGCCGGCCACCTTACTCACATCCTCTCTCTTCATCTCCTCCGCCCCCCCTTTCTCTCTCTTCCTTTACTATTAATTCCATATCACCATAAAGGAGCTAGAACAAAAAAAAAATCTGCAAATCCGTGCAAGAATTTGTTCCAAATTTTGACTGGAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005661
ATGATGCAATTCACCGAGAGCTTCCCCCCTCCGCACCAAATCCCCCCCTTCCCAAACCTCAAGGCCCGGGCGTGGCCGGGCCTCCCGCCGCCGAAGCAGCTGAGCAGCTTCGGCGACGCCAACTGCATGGAGCAGCTGCTGGTGCACTGCGCCACGGCCATCGAGACCAACGACGCCACCCTCGCCCAGCAGATCCTCTGGGTGCTCAACAACATCGCCCCGCCCGACGGCGACTCCAGCCAGCGCCTCACCTGCGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788667.1
MMQFTESFPPPHQIPPFPNLKARAWPGLPPPKQLSSFGDANCMEQLLVHCATAIETNDATLAQQILWVLNNIAPPDGDSSQRLTCAFLRALIARAARSGSCKLRTAVANVHAADLSTANHKFSIIELAGYVDLTPWHRFGFTAANAAVIEAVEGHPVVHIVDFSLTHCMQIPTLIDAIASRLDGPPLVKLTVAGATEDFPPMLDLSYEELGLKLVNFARSRNVAMEFRVIPSSSSDGFSSLIEQLRAIGAGAGGEALVIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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