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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001472`

染色体: Chr01 坐标: 28487620-28490257 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001472`
名称	SmilChr01G001472
描述	uncharacterized SmilChr01G001472
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28487620 - 28490257 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005664`
GeneID	`131005664`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005664`
原始查询	`LOC131005664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=25.9; qcov=0.668; evalue=1.13e-57; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=28.9; qcov=0.674; evalue=1.64e-67; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005664

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788675.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788675.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788675.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788675.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28487648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C46
`Chr1:28487649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B11,B17,B30,C30
`Chr1:28487653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B34,B61,B86,C36
`Chr1:28487657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B10
`Chr1:28487665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B36,B99,C85
`Chr1:28487673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:28487676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B61,C4
`Chr1:28487679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,C3,C5,C74
`Chr1:28487680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B61,C4
`Chr1:28487681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C20,C31,C56,C60
`Chr1:28487683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B55
`Chr1:28487690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788675.1

837 aa

418

837

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 452-546 aa PF00872 Transposase_mut 469-622 aa PF04434 SWIM 697-727 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788675.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	452	546	2.6e-19	70.1	MULE transposase domain
`XP_057788675.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	469	622	1.1e-10	41.7	Transposase, Mutator family
`XP_057788675.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	697	727	8.6e-08	32.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932692.1
AGAATTTGCATATTTTCGGAGACACAATGGCCAGTACGGTGTACATGATAAATCACCTGATGTTGGAGAATTCATTGAGCACTAATTACAGCTTGTATTATTTGACGAAGAGATTAAATGGCAGGGTATACAGTAAAAATACTCTTGCCGATGACAATGATTTGCTTCAGTTGCTGGCGTCCCAGCCACATTTTCCTGAGATTTATGTTGTCGAAGACGATTACAGTGGAGGAGTGTATGTTCCTTCGTTCGATCTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005664
ATGGCCAGTACGGTGTACATGATAAATCACCTGATGTTGGAGAATTCATTGAGCACTAATTACAGCTTGTATTATTTGACGAAGAGATTAAATGGCAGGGTATACAGTAAAAATACTCTTGCCGATGACAATGATTTGCTTCAGTTGCTGGCGTCCCAGCCACATTTTCCTGAGATTTATGTTGTCGAAGACGATTACAGTGGAGGAGTGTATGTTCCTTCGTTCGATCTCCCTCAATCTTCCGGGTATGGAGGTGAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788675.1
MASTVYMINHLMLENSLSTNYSLYYLTKRLNGRVYSKNTLADDNDLLQLLASQPHFPEIYVVEDDYSGGVYVPSFDLPQSSGYGGESSATFEGGDGLEAIQRYAYLDLSAGDSPAQQSVEPSVTWGNDQSTGWPSWDEPNPYRYDRLTIDRCWGPADDQYTYEPQFVENAGNVDEDYVPSSEAETDTSASEDLSEPENVRRAGIEYAGWQNLQIDDDDDEQVPGADELTNWLVPVIPLDAAAALVDIEDYQLLPRELSKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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