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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005366`

染色体: Chr01 坐标: 70882327-70885245 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005366`
名称	SmilChr01G005366
描述	omega-3 fatty acid desaturase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70882327 - 70885245 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005695`
GeneID	`131005695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005695`
原始查询	`LOC131005695`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	omega-3 fatty acid desaturase, chloroplastic-like
产物	omega-3 fatty acid desaturase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G05580` (FAD8) fatty acid desaturase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830441] identity=73.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0290300` (OsFAD7) - identity=69.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016717 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with oxidation of a pair of donors resulting in the reduction of molecular oxygen to two molecules of water)
KEGG	-
Pfam	PF00487 (FA_desaturase); PF11960 (DUF3474)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788711.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057788711.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788711.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788711.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70884155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:70884320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:70884752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B49,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788711.1

439 aa

220

439

DUF3474

FA_desaturase

PF11960 DUF3474 1-134 aa PF00487 FA_desaturase 141-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788711.1`	Pfam	`PF11960`	DUF3474	Family	1	134	3.9e-56	189.8	Domain of unknown function (DUF3474)
`XP_057788711.1`	Pfam	`PF00487`	FA_desaturase	Domain	141	396	5.4e-31	109.0	Fatty acid desaturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932728.1
AGTTGAATGTTGTTACACGCACCTCGCTATGAGAACAGATCGGCCCATATTCATTCACACCCACACTCACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAAGTTACGGTGGCGTCAACAGTAAGAGGGAGTAGTAGACCATGTATGCAATTGCAAGGACGAAAGCGACGTTGTAGTTTTGGTTGCTAACTCAGTGGAGGCATAGATGGTGGAGTTGGAAAGAGAAGAGAAATAGAGCCTCAAATTTGCGTATATAAATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005695
ATGACCAGTTGGGTTCTATCAGAATGTGGCTTAAGGCCACTTCCAAGAATCTACCTCAGGCCAAGAACTGGTCAATCTCTCTCCAAATCCAACCCCTCAAAGCTGAGAATCTCAAGAACAGATTTTTCCAATGATTCCTCATTCTGCTGTGTTGGTAGAGGGAGGAACTGGGGTTTGAAGGTGAGTGCCCCACTGAGATTTCAGGAGGTGGAGAAGGAGGAGAATGAGGAGAGAGAGAGTGTGGTAGTAAATGGTGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788711.1
MTSWVLSECGLRPLPRIYLRPRTGQSLSKSNPSKLRISRTDFSNDSSFCCVGRGRNWGLKVSAPLRFQEVEKEENEERESVVVNGADEFDPGAPPPFKLSDIRAAIPKHCWVKNPWRSMSYVVRDVAVVFGLAAVAAYFNNWAVWPLYWFAQGTMFWALFVLGHDCGHGSFSSDPKLNSVVGHLLHSSILVPYHGWRISHRTHHQNHGHVENDESWHPLSEKIYKQLDFVTKKLRFTLPFPMLAYPIYLWGRSPGKKGSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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