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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005379`

染色体: Chr01 坐标: 71013483-71015791 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005379`
名称	SmilChr01G005379
描述	GDSL esterase/lipase CPRD49-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71013483 - 71015791 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005709`
GeneID	`131005709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005709`
原始查询	`LOC131005709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase CPRD49-like
产物	GDSL esterase/lipase CPRD49-like
Arabidopsis	`AT3G11210` (AT3G11210) SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820291] identity=69.2; qcov=1; evalue=1.18e-118; confidence=high
Rice	`Os11g0708400` (OsGELP112) - identity=66.5; qcov=1; evalue=5.38e-115; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL); PF04311 (DUF459); PF13472 (Lipase_GDSL_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788731.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057788731.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788731.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788731.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71013744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A14,A24,B115,B117,B129,B20,B31,B34,B38,B39,B72,B73,B86,B98,C19,C28,C30,C32,C46,C52,C6,C68,C85,C87
`Chr1:71013766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C34,C48,C56,C65
`Chr1:71013785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:71013798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C71
`Chr1:71013820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C29,C60
`Chr1:71013850`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A22
`Chr1:71013850`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A22
`Chr1:71013884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:71013898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:71014053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:71014084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B29
`Chr1:71014131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788731.1

256 aa

128

256

Lipase_GDSL

Lipase_GDSL_2

DUF459

PF00657 Lipase_GDSL 10-203 aa PF13472 Lipase_GDSL_2 11-197 aa PF04311 DUF459 66-205 aa

XP_057788732.1

221 aa

110

221

Lipase_GDSL_2

Lipase_GDSL

DUF459

PF13472 Lipase_GDSL_2 4-162 aa PF00657 Lipase_GDSL 21-168 aa PF04311 DUF459 32-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788731.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	10	203	2.7e-21	77.4	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
`XP_057788731.1`	Pfam	`PF13472`	Lipase_GDSL_2	Domain	11	197	6.2e-23	82.9	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family
`XP_057788731.1`	Pfam	`PF04311`	DUF459	Family	66	205	2.3e-08	34.3	Protein of unknown function (DUF459)
`XP_057788732.1`	Pfam	`PF13472`	Lipase_GDSL_2	Domain	4	162	9.9e-19	69.3	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family
`XP_057788732.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	21	168	3.2e-16	60.8	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
`XP_057788732.1`	Pfam	`PF04311`	DUF459	Family	32	170	1.7e-08	34.8	Protein of unknown function (DUF459)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932748.1
ATTGATAGGAAAAGAAAAAAAACAAGTTTAGTTTCCCTTGATCCACTCTACAGTCTGCCTGCCCTAACTGGTGGAGTAGAAGTGTAATAGATAAGATTGCGATTGATTGCTTGGACAATCGTCGATCAATTCACAGAGAGAGATGGTGGGACCAACGAGGCCATTGTTCATGCTGTTTGGATCATCTATAGTTCAATTGAGCTTCAGTAATGGCGGTTGGGCTGCCATCCTCTCCGATATCTATGCCCGCAAAGCTGATA...

XM_057932749.1
TTAGTTTCCCTTGATCCACTCTACAGTCTGCCTGCCCTAACTGGTGGAGTAGAAGTGTAATAGATAAGATTGCGATTGATTGCTTGGACAATCGTCGATCAATTCACAGAGAGAGATGGTGGGACCAACGAGGCCATTGTTCATGCTGTTTGGATCATCTATAGTTCAATTGAGCTTCAGTAATGGCGGTTGGGCTGCCATCCTCTCCGATATCTATGCCCGCAAAGTTTGTCAATTTCATACCATTTCCTCTTTCACTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005709
ATGGTGGGACCAACGAGGCCATTGTTCATGCTGTTTGGATCATCTATAGTTCAATTGAGCTTCAGTAATGGCGGTTGGGCTGCCATCCTCTCCGATATCTATGCCCGCAAAGCTGATATAATTAGCAGAGGTTACTATGGTTGGAATTCAAGACGAGCTCTCCAAATCCTTGATCAAGTTTTCCCAAAGGATGCTGAAATTCAGCCGGAGTTGGTGATTGTGTATTTTGGTGGCAATGATTCCACGGGACCTCATTCATC...

LOC131005709
ATGAAGGCTGATATAATTAGCAGAGGTTACTATGGTTGGAATTCAAGACGAGCTCTCCAAATCCTTGATCAAGTTTTCCCAAAGGATGCTGAAATTCAGCCGGAGTTGGTGATTGTGTATTTTGGTGGCAATGATTCCACGGGACCTCATTCATCTGGACGAGGTCCTCACGTCCCTCTTCCAGAATACATTGAGAACATGAAGAAAATCGGAACCCATCTCAAGAATCTATCAGACAAGACTCGCGTAATATTTCTGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788731.1
MVGPTRPLFMLFGSSIVQLSFSNGGWAAILSDIYARKADIISRGYYGWNSRRALQILDQVFPKDAEIQPELVIVYFGGNDSTGPHSSGRGPHVPLPEYIENMKKIGTHLKNLSDKTRVIFLSCPPVDEAKIRNNSSFFSELVRTNELCRTYSEACMELCQELGVKAIDLYTAFQKREDWLDACFIKDGVHLSEEGSKMVAEEILKVLREAEWEPSLHWRSMATEFPEDSPYDLVAADGKRTLNPSEWTYHREIQWE

XP_057788732.1
MKADIISRGYYGWNSRRALQILDQVFPKDAEIQPELVIVYFGGNDSTGPHSSGRGPHVPLPEYIENMKKIGTHLKNLSDKTRVIFLSCPPVDEAKIRNNSSFFSELVRTNELCRTYSEACMELCQELGVKAIDLYTAFQKREDWLDACFIKDGVHLSEEGSKMVAEEILKVLREAEWEPSLHWRSMATEFPEDSPYDLVAADGKRTLNPSEWTYHREIQWE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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