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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005392`

染色体: Chr01 坐标: 71205989-71207958 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005392`
名称	SmilChr01G005392
描述	clathrin light chain 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71205989 - 71207958 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005721`
GeneID	`131005721`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005721`
原始查询	`LOC131005721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin light chain 2
产物	clathrin light chain 2
Arabidopsis	`AT2G40060` (CLC2) Clathrin light chain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818594] identity=55.8; qcov=0.953; evalue=6.15e-69; confidence=high
Rice	`Os04g0679100` - identity=61.4; qcov=0.728; evalue=5.07e-54; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030130 (clathrin coat of trans-Golgi network vesicle); GO:0030132 (clathrin coat of coated pit); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01086 (Clathrin_lg_ch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005721

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788754.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788754.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057788754.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788754.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71206154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:71206375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C60
`Chr1:71206388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr1:71206405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B13,B90,B92,C2
`Chr1:71206669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B35,B82
`Chr1:71207548`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr1:71207548`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr1:71207577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:71207630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:71207673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B10,B122,B32,B93
`Chr1:71207712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C86
`Chr1:71207737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B94,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788754.1

235 aa

118

235

Clathrin_lg_ch

PF01086 Clathrin_lg_ch 75-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788754.1`	Pfam	`PF01086`	Clathrin_lg_ch	Family	75	213	2.1e-08	35.1	Clathrin light chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932771.1
TTGATTAAATCCCTAATCAGATATAAAACATTCCATATATTAATTAATTTTATAATGGGCTGCAATTATAGGGCCCACAAAACAATTAGCTATCCCCAAATTCTTGTTTTTTCCGTTGCCGAAAAAAATCATTTCTTGAGTGCCTAATCAGTAATCACAGCAATTGCCGAACATCACCAAAACCGATCGCACACACGATGTCGTATTCTTTCGCCGCCTCGCTCGATCAATTCGGTGTTGACTCGCCGGTATCCGCCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005721
ATGTCGTATTCTTTCGCCGCCTCGCTCGATCAATTCGGTGTTGACTCGCCGGTATCCGCCGGGACTCATTCGTTTGACGACGGCTACTCGTTTTCCAACTTCGATTCTACCGTCGCCGACTCTCCCCCGCCGATCTACGTCTCCGGCGGAGAGTTCATTGATCCGGCGTTTTTCTCGTCGGAAACAAAGGAAAACGGCCCGATTCTACCGCCGCCGGCCGAGATGGAGCACGAGGAGAGCTATGCGCTCAGAGAATGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788754.1
MSYSFAASLDQFGVDSPVSAGTHSFDDGYSFSNFDSTVADSPPPIYVSGGEFIDPAFFSSETKENGPILPPPAEMEHEESYALREWRRQNTIRLEEKEKRQKELLSQIIVEADEYKVEFHRKRQIISENNRATNREKEQVLVAKLEKFHAEADKDYWKSIAELIPKEVPTIEKRKGKKDDEKKASIVVVRGPKPGKPTDLSRMRQLLLKLKHSSPPHLNQSPDVPVVTKEPMAVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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