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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005397`

染色体: Chr01 坐标: 71236077-71238633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005397`
名称	SmilChr01G005397
描述	xylan O-acetyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71236077 - 71238633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005724`
GeneID	`131005724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005724`
原始查询	`LOC131005724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xylan O-acetyltransferase 1-like
产物	xylan O-acetyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G55990` (ESK1) trichome birefringence-like protein (DUF828) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824765] identity=66.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0291800` (OsTBL15) - identity=68.3; qcov=0.754; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057788761.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788761.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788761.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788761.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71236267`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A1,A18,A2,A20,A22,A3,A5,B101,B117,B124,B136,B137,B14,B140,B18,B2,B21,B26,B27,B28,B3,B32,B36,B37,B49,B54,B61,B62,B72,B78,B80,B98,C1,C12,C26,C28,C29,C38,C4,C40,C54,C58,C59,C61,C67,C78,C80,C83,C84,C9,D2
`Chr1:71236321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C31
`Chr1:71236330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:71236345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B75
`Chr1:71236366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C7
`Chr1:71236426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71236521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,C9
`Chr1:71236595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:71236611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,C7
`Chr1:71236681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:71236853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C78
`Chr1:71237263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788761.1

468 aa

234

468

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 119-173 aa PF13839 PC-Esterase 174-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788761.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	119	173	1.6e-23	83.5	PMR5 N terminal Domain
`XP_057788761.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	174	462	2.7e-94	317.0	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932778.1
AAAATTTCAACTCAGTCCCTTTCTCCCTCCCACGCCCTCTTCCTCTCTTGCTTGTTTGATCATCAAAAACATTCGTTTTCAAACCCCTTAAATTTCCCCCCTTAACTTCATTTCCCCACCACCCCTGCTCTCTCATGCGCCGGCGATTCATCCTCATGAAGCCCGCCGCCTCCTCCGCCGGCCGCAAGGGGAACAGCAGCCTCCCCATATTCGTCATCGTCATCTCCGTCTTCGCCTTCGGCTGCTTCATGTACAACGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005724
ATGCGCCGGCGATTCATCCTCATGAAGCCCGCCGCCTCCTCCGCCGGCCGCAAGGGGAACAGCAGCCTCCCCATATTCGTCATCGTCATCTCCGTCTTCGCCTTCGGCTGCTTCATGTACAACGAGGACGTCAAGTCCATCGCCGAATTCTCATTCTCTCGCCCCTCGCCCCCAGAAACCGAAACCGCCGCCGTGGAGGTGGTGGTGAATTCCAGGACCGTGGTGGAGGCCCAAGTGAACGACGACGACGGCGGCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788761.1
MRRRFILMKPAASSAGRKGNSSLPIFVIVISVFAFGCFMYNEDVKSIAEFSFSRPSPPETETAAVEVVVNSRTVVEAQVNDDDGGGGRKQELDAVVLKSNRESGDEEEEEDQEIENPNEECDLFKGNWVFDNVTHPLYKEEECEFLTAQVTCMRNGRKDSRYQNWRWQPTDCSLPKFRARLLLEKLRNKRLMFVGDSLNRNQWESMICLVQSVVPPGRKSLNKTASLSIFKIEDYNATVEFYWAPFLVESNSDDPKLHSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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