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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001491`

染色体: Chr01 坐标: 28721039-28721521 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001491`
名称	SmilChr01G001491
描述	uncharacterized SmilChr01G001491
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28721039 - 28721521 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005725`
GeneID	`131005725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005725`
原始查询	`LOC131005725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0685100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0685100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=31.1; qcov=0.744; evalue=8.75e-06; confidence=low
Rice	`Os01g0685100` - identity=26.2; qcov=0.906; evalue=1.22e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788765.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057788765.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057788765.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788765.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28721045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:28721061`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A18,A9,B102,B105,B110,B125,B135,B32,B55,B56,B65,B66,B85,B89,B96,C5,C73,C8,C83,D1
`Chr1:28721069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B1,B133,B7,B86,B9,C26,C33
`Chr1:28721100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:28721110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:28721114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B47,D1
`Chr1:28721121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:28721143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B54,B69,C73
`Chr1:28721211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:28721240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:28721253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B51,B92,D8
`Chr1:28721259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C10,C38,C64,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788765.1

160 aa

160

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 2-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788765.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	2	56	4.4e-10	40.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932782.1
ATGGTGCTGACTTGGAGATTGCTCAAAAATCGATTACCAACTTGCGACAACTTGAAGAGAAGAATGGTGTTGACAGATGAAGGTGAATGTGGCTGCAATGGATGCTTGCAACAACTTGAGACTGCTCACCATGCATTTCTTCAGTGTCCAAAGACAACTAAAGTGTGGGATGGCATCTTGGAGTGGCTGGGGATTAATTTTGTTCCTCCTCAAGGGGTTGCTGATCACTTTGCTCAATTCTCACATCTTTGTGTTAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005725
ATGGTGCTGACTTGGAGATTGCTCAAAAATCGATTACCAACTTGCGACAACTTGAAGAGAAGAATGGTGTTGACAGATGAAGGTGAATGTGGCTGCAATGGATGCTTGCAACAACTTGAGACTGCTCACCATGCATTTCTTCAGTGTCCAAAGACAACTAAAGTGTGGGATGGCATCTTGGAGTGGCTGGGGATTAATTTTGTTCCTCCTCAAGGGGTTGCTGATCACTTTGCTCAATTCTCACATCTTTGTGTTAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788765.1
MVLTWRLLKNRLPTCDNLKRRMVLTDEGECGCNGCLQQLETAHHAFLQCPKTTKVWDGILEWLGINFVPPQGVADHFAQFSHLCVNKRSENFLMALWSCTCWLIWKWRNESRWEGKTWEIPKAIMEIKARMWSWNKIFKIIEVDVSLACWMNCKLSCWLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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