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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005409`

染色体: Chr01 坐标: 71341732-71345043 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005409`
名称	SmilChr01G005409
描述	uncharacterized SmilChr01G005409
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71341732 - 71345043 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005736`
GeneID	`131005736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005736`
原始查询	`LOC131005736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OJ1439_F07.19-1; symbol=OJ1439_F07.19-1; hit=Os09g0526800; species=rice; confidence=medium
产物	OJ1439_F07.19-1; symbol=OJ1439_F07.19-1; hit=Os09g0526800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G00905` (AT4G00905) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827986] identity=49.4; qcov=0.519; evalue=4.42e-72; confidence=medium
Rice	`Os09g0526800` (OJ1439_F07.19-1) - identity=49.6; qcov=0.501; evalue=5.08e-73; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT); PF21473 (OB_Ssb-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788772.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057788772.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057788772.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788772.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71342139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B36,B65
`Chr1:71342166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,C1,C33,C5,C70
`Chr1:71342167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71342204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:71342295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B67,C11,C69
`Chr1:71342326`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C84
`Chr1:71342326`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C84
`Chr1:71342331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C84,D10
`Chr1:71342397`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B106
`Chr1:71342397`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B106
`Chr1:71343107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:71343160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788772.1

499 aa

250

499

LRAT

OB_Ssb-like

PF04970 LRAT 13-163 aa PF21473 OB_Ssb-like 376-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788772.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	13	163	1.1e-27	97.4	Lecithin retinol acyltransferase
`XP_057788772.1`	Pfam	`PF21473`	OB_Ssb-like	Domain	376	471	1.2e-44	151.1	Single-stranded DNA binding protein Ssb-like, OB fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932789.1
ACTGAAGGTCTCCGGTTCGAGTCCGGGCGACGCCATTTGAAAGCATTTTTTTCATTATTTTTTACATTTTCATGGCATCTTAAAGTTTTTATGTGGACTGCTAAATAGAAGTCTTGGTCATAAATTGATTTTTTTTTTTTGAGAATCTGCCATAAATTGATTCTTGTGCTATATTTAACGTAAATTTTGCCTTGAAAATTGAAAAAGTGTTGATTTTGCCTTGGTAGAAGGAAAATCTGTATCAATTTTCCTCGTGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005736
ATGGGGTTTCTCACACAAAGGGTGGAACGAAGCGATTTAGAAGCAGGGGACCATATCTACACTTGGAGGACTCCCGTGTTCGCATACTCTCATCATGGCATCTATATTGGTGATAACAAAGTGGTGCACTTCACTCAAGTTCAGAATTTGAGCTCTGATGACTCTAGTTCCTTTTTCTCCTCATCATCAGTTGCAGCAGTCTGTTTAAATTTTGAAGAAAAATGTGAGGTTAAGAAACATAAAAATGGAGTTGTTATGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788772.1
MGFLTQRVERSDLEAGDHIYTWRTPVFAYSHHGIYIGDNKVVHFTQVQNLSSDDSSSFFSSSSVAAVCLNFEEKCEVKKHKNGVVMSCLNCFLGNGSLYRFEYGVSALALVTKLRSGTCTTAKSDPPGDVIRRALYLLEIGFGKYDALSNNCEDFALYCKTGLVVIRQDDSEGHRSGQSSSVAAAIDSFIFSLSTKIFSSNPYVLGATTVGRYTFGRYVTDVGVRSDVIKLEVEAFALLLGELPAEDQPKKHGDLPAEEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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