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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005417`

染色体: Chr01 坐标: 71382500-71388769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005417`
名称	SmilChr01G005417
描述	lysine-specific demethylase ELF6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71382500 - 71388769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005744`
GeneID	`131005744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005744`
原始查询	`LOC131005744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-specific demethylase ELF6
产物	lysine-specific demethylase ELF6
Arabidopsis	`AT5G04240` (ELF6) Zinc finger (C2H2 type) family protein / transcription factor jumonji (jmj) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830303] identity=54.6; qcov=0.678; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0151300` (JMJ701) - identity=47.3; qcov=0.483; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0034647 (histone H3K4me/H3K4me2/H3K4me3 demethylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02373 (JmjC); PF02375 (JmjN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788783.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057788783.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788783.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788783.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71383094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B45,B8,C77,D1
`Chr1:71383406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:71383484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71383586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71383671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:71383819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B10
`Chr1:71384406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B5,C33
`Chr1:71385438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C65
`Chr1:71385657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C61
`Chr1:71385785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B5,B87,C33
`Chr1:71386367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:71386408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B75,C14,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788783.1

1362 aa

681

1362

JmjN

JmjC

PF02375 JmjN 17-50 aa PF02373 JmjC 326-444 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788783.1`	Pfam	`PF02375`	JmjN	Family	17	50	5e-15	55.7	jmjN domain
`XP_057788783.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	326	444	1.1e-34	120.0	JmjC domain, hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932800.1
AATAATTTGCCGCGCGCGTCGCCGGCGCTATATTGCGCGCTACGAGCACCGCGCACACCCCCCATAAGATATTCGCGGTGGGCCCGACTAATAAAACATAAATTTAAACCTCCCAACAGCCTAGCAACAGTGAAATACACGCCGCGCTCACGTTAGCCACTGCGCATCCTTACAATCCCGCGGTCTATCTTGCGCACACTGATTTTCTCCCAAATCAAAAAACCTAGACCCCTCCACCTCAAAAATTCATGCTCGCATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005744
ATGAAGAATGTTGAAATACCCAAATGGCTTGAGAGGTTGCCTTTGGCGCCTGAATTCCACCCGACCGATACTGAATTCGCCGACCCAATTGCTTACATATCTAAGATAGAGAAAGAGGCGAGTGCTTTTGGCATTTGTAAAGTGATTCCGCCATTGCCAAAGCCGTCTAGAAAGTATGTACTTCATAACTTGAATAAGTCTCTTTCCAAGTGTCCGGAATTGGATGGGGATGTGAATCTTGTTTCGTCGTCGAAGACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788783.1
MKNVEIPKWLERLPLAPEFHPTDTEFADPIAYISKIEKEASAFGICKVIPPLPKPSRKYVLHNLNKSLSKCPELDGDVNLVSSSKTDGDVRNNCDRKYRAVFTTRQQELGCEKGKKVKEALGDHLLGAQKQVWQSGEVYTLEQFEAKAKTFAKSTLGVVKDVNPLVIETMFWKATLEKPIYVEYANDVPGSGFSEPEGLLRYFDRRRRRRKTRKRNSFDRNNLGNSDSKIDQVEKVNNVSDNKDSGSQNKPSSCTETVLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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