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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001494`

染色体: Chr01 坐标: 28770372-28774508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001494`
名称	SmilChr01G001494
描述	uncharacterized SmilChr01G001494
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28770372 - 28774508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005752`
GeneID	`131005752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005752`
原始查询	`LOC131005752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.2; qcov=0.32; evalue=1.58e-41; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=29.2; qcov=0.576; evalue=5.37e-100; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788797.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788797.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788797.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788797.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788797.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28770378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr1:28770388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C11,C69,C83
`Chr1:28770388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C83
`Chr1:28770418`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A10,A19,B103,B105,B111,B114,B118,B120,B123,B137,B2,B22,B30,B31,B34,B45,B48,B6,B64,B65,B70,B71,B75,B79,B8,B80,B93,C2,C25,C30,C34,C38,C58,C7,D1,D8
`Chr1:28770429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C6,C84
`Chr1:28770429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C84
`Chr1:28770441`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	75	A1,A18,A21,A8,A9,B1,B100,B101,B108,B109,B111,B113,B117,B118,B121,B125,B126,B127,B129,B131,B136,B140,B15,B19,B2,B27,B37,B40,B45,B47,B49,B54,B55,B56,B58,B71,B74,B75,B76,B78,B80,B90,B91,B92,B94,B96,B97,C10,C17,C18,C19,C20,C22,C23,C31,C33,C40,C43,C45,C50,C56,C65,C7,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C82,C85,C87,D5,D7
`Chr1:28770443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B32,C83
`Chr1:28770445`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A1,A21,A9,B1,B100,B101,B108,B109,B111,B113,B117,B118,B121,B125,B127,B129,B131,B136,B140,B15,B19,B27,B37,B45,B47,B49,B54,B55,B58,B71,B74,B75,B78,B80,B90,B91,B92,B94,B96,C10,C17,C18,C19,C20,C23,C31,C33,C40,C43,C45,C50,C56,C65,C7,C70,C73,C74,C75,C77,C8,C82,C85,C87,D5,D7
`Chr1:28770454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:28770484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,D3
`Chr1:28770514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A11,A2,B123,B13,B46,B49,B79,B8,C2,C42,C45,C60,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788797.1

1378 aa

689

1378

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 499-759 aa PF13966 zf-RVT 1021-1096 aa PF13456 RVT_3 1227-1345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788797.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	499	759	3.7e-30	106.0	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057788797.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	1021	1096	1.5e-11	45.5	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057788797.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1227	1345	1.7e-19	70.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932814.1
ATGAACGTGATTTCCTGGAATGTGAGAGGGCTTAATGATGAGTCACGTCAAGTCCTCCAGGAACATTGTACCAGATTCTCTCCCATGCTCTTGGGAATTATTGAGCCAAAAGCGGCTTTTGCTAAAATTCCTTCTTCTTTTTGGAATTCTATTAATATGGTGCTGATACATCAGAATTCGCGTGTTGGTATGAGCTCCAATATTTGGGTTTTCGCAACTCCACAGGTTTCTGCCTCTCTGGTTTACTCGTCGAATCAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005752
ATGAACGTGATTTCCTGGAATGTGAGAGGGCTTAATGATGAGTCACGTCAAGTCCTCCAGGAACATTGTACCAGATTCTCTCCCATGCTCTTGGGAATTATTGAGCCAAAAGCGGCTTTTGCTAAAATTCCTTCTTCTTTTTGGAATTCTATTAATATGGTGCTGATACATCAGAATTCGCGTGTTGGTATGAGCTCCAATATTTGGGTTTTCGCAACTCCACAGGTTTCTGCCTCTCTGGTTTACTCGTCGAATCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788797.1
MNVISWNVRGLNDESRQVLQEHCTRFSPMLLGIIEPKAAFAKIPSSFWNSINMVLIHQNSRVGMSSNIWVFATPQVSASLVYSSNQAVIIDCCWYSRKFRAVFVHGDNLLNERRRLWVDLLTHIIDNTFFIGDFNAVKGAHERKSNRIPCASSCRDFCDFIAASGFIESEVTGLFFTWCGRRLLPSHVESVLDRCLFSEGFSSLWDSLNTHVLPWISSDHSPIVLQCHENGGPRRSRFKFFDMWLLHPEFKQVVQDSWNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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