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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000234`

染色体: Chr01 坐标: 4395398-4396261 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000234`
名称	SmilChr01G000234
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	4395398 - 4396261 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005767`
GeneID	`131005767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005767`
原始查询	`LOC131005767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32.1; qcov=0.728; evalue=1.53e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=31.5; qcov=0.686; evalue=7.26e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788857.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788857.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788857.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788857.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:4395404`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A1,B110,C35
`Chr1:4395404`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A1,B110,C35
`Chr1:4395416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B110,C35,C6
`Chr1:4395431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B110,B81,C35,C6
`Chr1:4395443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B110,C35,C6
`Chr1:4395471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B110,C35,C6
`Chr1:4395491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B110,C35,C6
`Chr1:4395586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:4395672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:4395682`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A15,A23,A4,B1,B103,B105,B109,B133,B136,B137,B139,B140,B18,B2,B30,B33,B36,B39,B42,B55,B58,B60,B64,B69,B73,B80,B83,C10,C11,C17,C18,C19,C2,C20,C33,C40,C44,C45,C46,C48,C53,C59,C61,C67,C69,C79,D1,D10,D2,D5,D8
`Chr1:4395686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B135,B136,C39
`Chr1:4395712`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,B124,B133,B16,B71,B73,B91,C11,C67,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788857.1

287 aa

144

287

FAR1

PF03101 FAR1 103-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788857.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	103	193	4.4e-16	60.1	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932874.1
ATGGATTTTGATTTGAACGATTATCCATCTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATTGTCAAGGAAGGAAGCATGTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAATGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATCAAAGTCTTGAAGAAGTTGAGGAAAATATTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCATGATTATGGCAAATTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005767
ATGGATTTTGATTTGAACGATTATCCATCTAATGATGTTGGCGATGAAGATGAAGTATTGTCAAGGAAGGAAGCATGTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAATGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATCAAAGTCTTGAAGAAGTTGAGGAAAATATTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCATGATTATGGCAAATTTGTCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788857.1
MDFDLNDYPSNDVGDEDEVLSRKEACVDENNVENRNEDCDDNSDVGDGDKDQSLEEVEENIEDEQHVEHDYGKFVDLLNRIDVLEMVLEVGKSVQDPEAAHILYCEYARLKGFSVTRDNKGYFNGTRICSYKTFLCSCHGKSETNTSLDRGMATYKKQDRKITCKAKLRVSRRRNQPWKVRSWYKEHNHELFPSDQSYLLRSARSLSKSKKLLIESMNSVGIGISRAYAFMEKESGGPQNCGFTRKDAYNHINGIKMKTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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