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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005438`

染色体: Chr01 坐标: 71509433-71513927 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005438`
名称	SmilChr01G005438
描述	uncharacterized SmilChr01G005438
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71509433 - 71513927 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005768`
GeneID	`131005768`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005768`
原始查询	`LOC131005768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0100600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0100600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0100600` - identity=37.8; qcov=1.04; evalue=1.99e-38; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF01424 (R3H); PF12752 (SUZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005768

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788819.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788821.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788821.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057788822.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057788822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71509839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B66,C60
`Chr1:71509930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:71509960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B66,C60
`Chr1:71509962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,C48,C51,C84
`Chr1:71509966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B66,C60
`Chr1:71509996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:71509998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B66,C60
`Chr1:71510036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B66,C60
`Chr1:71510250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B61,B65,C52
`Chr1:71510317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71511212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:71511235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788819.1

299 aa

150

299

R3H

SUZ

PF01424 R3H 28-85 aa PF12752 SUZ 131-154 aa

XP_057788820.1

275 aa

138

275

SUZ

PF12752 SUZ 107-130 aa

XP_057788821.1

249 aa

124

249

SUZ

PF12752 SUZ 81-104 aa

XP_057788822.1

248 aa

124

248

R3H

SUZ

PF01424 R3H 1-34 aa PF12752 SUZ 80-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788819.1`	Pfam	`PF01424`	R3H	Domain	28	85	1.1e-13	51.7	R3H domain
`XP_057788819.1`	Pfam	`PF12752`	SUZ	Domain	131	154	4e-06	28.2	SUZ domain
`XP_057788820.1`	Pfam	`PF12752`	SUZ	Domain	107	130	3.5e-06	28.4	SUZ domain
`XP_057788821.1`	Pfam	`PF12752`	SUZ	Domain	81	104	2.8e-06	28.7	SUZ domain
`XP_057788822.1`	Pfam	`PF01424`	R3H	Domain	1	34	1.5e-09	38.4	R3H domain
`XP_057788822.1`	Pfam	`PF12752`	SUZ	Domain	80	103	2.6e-06	28.8	SUZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932838.1
ATAAAAAGAAAGGGAGTGGATATTAAAGGGATGCAAAATTGAATAATGGCACAAGTTGGTAGAGAGAGAGGCAGCTCGCGAGCGGCGGAAGCGGAGGAAGATTGAAGACGGCGGTGACGCCACCATGACTCTCGCTCAATTCTCCATGGTTGAAGAGTTGGCTTCTCTTGTTAAAGACAATTATCCTTGCAAGCATCTAATTTTGTCAGTGGAAGATCTGTTAGTGAATTATCTTCAGGATGATACAAGTCCAGGCATCC...

XM_057932837.1
ATAAAAAGAAAGGGAGTGGATATTAAAGGGATGCAAAATTGAATAATGGCACAAGTTGGTAGAGAGAGAGGCAGCTCGCGAGCGGCGGAAGCGGAGGAAGATTGAAGACGGCGGTGACGCCACCATGACTCTCGCTCAATTCTCCATGGTTGAAGAGTTGGCTTCTCTTGTTAAAGACAATTATCCTTGCAAGCATCTAATTTTGTCAGTGGAAGATCTGTTAGTGAATTATCTTCAGGATGATACAAGTTTAGATGGAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131005768
ATGACTCTCGCTCAATTCTCCATGGTTGAAGAGTTGGCTTCTCTTGTTAAAGACAATTATCCTTGCAAGCATCTAATTTTGTCAGTGGAAGATCTGTTAGTGAATTATCTTCAGGATGATACAAGTCCAGGCATCCTTGTGAGCGATTTATTGTTGCAATATGGTGAAATGCAGACGCCGATGACTTGTGATGTATTAAGGCGTAAGGAAGTTTTGCCGCCAGACCAGAAGGTTGATCCTGTAAGCGGGCCTTCTCTGGA...

LOC131005768
ATGACTCTCGCTCAATTCTCCATGGTTGAAGAGTTGGCTTCTCTTGTTAAAGACAATTATCCTTGCAAGCATCTAATTTTGTCAGTGGAAGATCTGTTAGTGAATTATCTTCAGGATGATACAAGTTTAGATGGAGTGCTCGAGCTGGAACCTATGAATTCTTATAGCCGCCTACTTGTACACCGTCTTGCTGAAATATTTGGTCCAGGCATCCTTGTGAGCGATTTATTGTTGCAATATGGTGAAATGCAGACGCCGAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057788819.1
MTLAQFSMVEELASLVKDNYPCKHLILSVEDLLVNYLQDDTSLDGVLELEPMNSYSRLLVHRLAEIFGFFHHSVGEGEDRHLVLERSPETSIPGILVSDLLLQYGEMQTPMTCDVLRRKEVLPPDQKVDPVSGPSLDERETAYFAARERIFSEDACDSKLVKERPKKDPVVARRMITRALGQADKGTKHELTKEFVQLVVEDERNIKSSNKMKINPLSEKNPRASTMPKVDRSDEFKVVDVSSKEPQHSKGRDSLAELKS...

XP_057788820.1
MTLAQFSMVEELASLVKDNYPCKHLILSVEDLLVNYLQDDTSLDGVLELEPMNSYSRLLVHRLAEIFGPGILVSDLLLQYGEMQTPMTCDVLRRKEVLPPDQKVDPVSGPSLDERETAYFAARERIFSEDACDSKLVKERPKKDPVVARRMITRALGQADKGTKHELTKEFVQLVVEDERNIKSSNKMKINPLSEKNPRASTMPKVDRSDEFKVVDVSSKEPQHSKGRDSLAELKSDMPDNYLRQEHMGAAKRLFANALR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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