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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005456`

染色体: Chr01 坐标: 71598441-71600735 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005456`
名称	SmilChr01G005456
描述	sabinene synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71598441 - 71600735 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005775`
GeneID	`131005775`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005775`
原始查询	`LOC131005775`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sabinene synthase 1, chloroplastic-like
产物	sabinene synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G25820` (TPS-CIN) terpene synthase-like sequence-1,8-cineole [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822175] identity=41.4; qcov=0.921; evalue=8.9e-149; confidence=medium
Rice	`Os04g0344100` - identity=29.7; qcov=0.844; evalue=1.22e-69; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG	smil00902 (Monoterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005775

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057788838.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788838.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057788838.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788838.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71598559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:71598637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B30
`Chr1:71598684`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	42	B103,B105,B107,B108,B113,B125,B130,B139,B140,B23,B27,B30,B38,B43,B47,B6,B60,B63,B80,B84,B90,B91,C10,C13,C18,C19,C2,C29,C31,C39,C4,C52,C57,C60,C67,C70,C76,C78,C8,C85,D2,D3
`Chr1:71598689`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	B103,B105,B107,B108,B113,B125,B130,B139,B140,B23,B27,B30,B38,B43,B60,B63,B80,B84,B90,B91,C10,C13,C18,C19,C2,C29,C31,C39,C4,C52,C57,C60,C67,C70,C76,C85,D2,D3
`Chr1:71598800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:71598818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B59,B80
`Chr1:71598889`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A14,A18,A19,A25,A5,B102,B105,B110,B129,B17,B24,B25,B28,B41,B46,B5,B54,B69,B72,B82,B86,C25,C28,C29,C32,C4,C45,C46,C6,C68,C73,C85,C86,D4
`Chr1:71598902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B81
`Chr1:71598914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B67,C14,C34,C43
`Chr1:71599117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr1:71599233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B78,B83
`Chr1:71599286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788838.1

598 aa

299

598

Terpene_synth

Terpene_synth_C

Terpene_syn_C_2

PF01397 Terpene_synth 65-245 aa PF03936 Terpene_synth_C 305-542 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 344-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788838.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	65	245	6.8e-41	140.8	Terpene synthase, N-terminal domain
`XP_057788838.1`	Pfam	`PF03936`	Terpene_synth_C	Domain	305	542	2.9e-83	279.6	Terpene synthase family, metal binding domain
`XP_057788838.1`	Pfam	`PF19086`	Terpene_syn_C_2	Domain	344	542	1.6e-51	175.6	Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932855.1
CATTATATAAAAGTGATCATAAAAATGTCTACAATTAGCATGAACGTAGTGATCCTTAGCAAGCCACTAAATTCTCTCCACAAGTTGGAGAGTAGAGCTTTAAAATCAAAAGCGTGTACAGCACCCGCACCCGCTGCTTCTGCTTGCCTCCGCAGCTCCATACAAGCTGCAGAAGCTCCTCAAATCCGACGCTCTGGAAACTACAAGCCTTCTCTTTGGGATTTCAATTACATTCAGTCTCTCAACACTCCCTATAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005775
ATGTCTACAATTAGCATGAACGTAGTGATCCTTAGCAAGCCACTAAATTCTCTCCACAAGTTGGAGAGTAGAGCTTTAAAATCAAAAGCGTGTACAGCACCCGCACCCGCTGCTTCTGCTTGCCTCCGCAGCTCCATACAAGCTGCAGAAGCTCCTCAAATCCGACGCTCTGGAAACTACAAGCCTTCTCTTTGGGATTTCAATTACATTCAGTCTCTCAACACTCCCTATAAGGAGGAGAGGCACTTGAATAGGCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788838.1
MSTISMNVVILSKPLNSLHKLESRALKSKACTAPAPAASACLRSSIQAAEAPQIRRSGNYKPSLWDFNYIQSLNTPYKEERHLNRQAELIMQVKMLLKDKMEALQQLELIHDLKYLGLSFFFQDEIKQILGSIYNEHRGFHNNDVEEKDLYLTALGFRLLRQYGFNVSQEMFNCFKNKKGNDFKASLGQDTKAMLQLYEASFLLREGEDTLELARIFSTKCLQKKLEEGGDEIDEDLLSWIRHSLDLPLHWRVQGLEARW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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