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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001506`

染色体: Chr01 坐标: 28891086-28893542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001506`
名称	SmilChr01G001506
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	28891086 - 28893542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005779`
GeneID	`131005779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005779`
原始查询	`LOC131005779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=25.8; qcov=0.862; evalue=1.17e-37; confidence=low
Rice	`Os03g0822100` - identity=33.6; qcov=0.7; evalue=2.07e-60; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788847.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788847.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788847.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788847.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:28891092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B8,C36,C82,C85
`Chr1:28891115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	74	A10,A24,A5,A7,B103,B104,B108,B110,B114,B115,B120,B126,B128,B132,B135,B138,B139,B140,B15,B19,B21,B24,B33,B36,B38,B40,B5,B50,B52,B62,B70,B72,B77,B78,B8,B84,B85,B88,B89,B91,B95,B96,B99,C12,C13,C23,C24,C28,C3,C32,C36,C39,C43,C45,C46,C47,C50,C54,C58,C59,C6,C63,C66,C67,C68,C73,C76,C79,C80,C82,C85,C87,D4,D9
`Chr1:28891445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C83
`Chr1:28891451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:28891458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C1,C52
`Chr1:28891458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C52
`Chr1:28891466`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	77	A1,A10,A19,A22,A23,A5,B101,B102,B105,B11,B112,B114,B120,B129,B13,B132,B134,B15,B20,B22,B23,B26,B28,B29,B31,B4,B40,B47,B50,B56,B6,B63,B65,B66,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B89,B91,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C25,C28,C29,C38,C39,C40,C43,C46,C47,C49,C55,C57,C58,C62,C68,C7,C71,C79,C83,C9,D10,D5
`Chr1:28891469`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A24,A6,B103,B110,B118,B119,B13,B137,B15,B59,B61,B62,B65,B76,B8,C16,C21,C31,C32,C35,C37,C5,C68,C70,C71,C73,C75,C81,C86,D1,D3,D7,D9
`Chr1:28891485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:28891503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C52
`Chr1:28891552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B37,B63
`Chr1:28891573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788847.1

463 aa

232

463

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

PF27041 ZBED1_RNase-like 155-227 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 231-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788847.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	155	227	7.8e-16	58.7	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057788847.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	231	340	8.5e-35	119.9	ZBED1 RNase-like helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932864.1
ATGTTGACTCCAAACACTGAATCAGCTCAAGAGTCGACTACTAGTCCGGCATTTGTATCTCCTAGTGTAGATGCTTTGGATGGAGGTACACCACAAGTGGATACGAGTCAGACTCAAGCTGAAGATGTTGCTGAAAATCCATTTCAGCCTAAGAAAAGCAAGCTTCAGAAATCTAAGGGTCAGCAGAATCTCACCGTTACGAAGACATTATCAATGAAAGAAACAGTGTCTTCGGTGCAGAATTTTCAGTACGACCATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005779
ATGTTGACTCCAAACACTGAATCAGCTCAAGAGTCGACTACTAGTCCGGCATTTGTATCTCCTAGTGTAGATGCTTTGGATGGAGGTACACCACAAGTGGATACGAGTCAGACTCAAGCTGAAGATGTTGCTGAAAATCCATTTCAGCCTAAGAAAAGCAAGCTTCAGAAATCTAAGGGTCAGCAGAATCTCACCGTTACGAAGACATTATCAATGAAAGAAACAGTGTCTTCGGTGCAGAATTTTCAGTACGACCATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788847.1
MLTPNTESAQESTTSPAFVSPSVDALDGGTPQVDTSQTQAEDVAENPFQPKKSKLQKSKGQQNLTVTKTLSMKETVSSVQNFQYDHSKLREIISHMIIVHELPFCFSEYELFNLAMQTATSHYQKISRAMAKKDCISSYKMEKKKLMVQLKSVNHWQLQKMTFNFYDIPPPHTGIAISVMLQKCLAEWGIEKKVWTLTVDNAANNDVVVRLLRDNLLFNGTLHLGGKIFHVRCCAHILNLLVLDGLTPIQDIIYKVRESV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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