当前解析结果
SmilChr01G001509| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001509 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001509 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001509 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 28925783 - 28929363 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005804 |
|---|---|
| GeneID | 131005804 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005804 |
| 原始查询 | LOC131005804 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005804 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788877.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057788877.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788877.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788877.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788877.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:28925810 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C20 |
Chr1:28925810 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
Chr1:28925812 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B26,B40,B80,B93,C39 |
Chr1:28925813 |
A |
AGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B27,C29 |
Chr1:28925813 |
A |
AGT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B27,C29 |
Chr1:28925815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr1:28925822 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B60,B72,C20,C29 |
Chr1:28925823 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B82,C16,C68 |
Chr1:28925824 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B56,B96 |
Chr1:28925824 |
C |
CAA |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr1:28925829 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B132,B26,B80,C39 |
Chr1:28925837 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A21,B32,B60,B64,B72,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。