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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005473`

染色体: Chr01 坐标: 71716661-71719500 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005473`
名称	SmilChr01G005473
描述	putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71716661 - 71719500 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005805`
GeneID	`131005805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005805`
原始查询	`LOC131005805`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
产物	putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
Arabidopsis	`AT3G55950` (CCR3) CRINKLY4 related 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824761] identity=57.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0127300` (OsCRR3) - identity=70.9; qcov=0.424; evalue=1.85e-159; confidence=low
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788875.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788875.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788875.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788875.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71716946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:71716980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C60
`Chr1:71716993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:71717154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C14,C39
`Chr1:71717162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B36
`Chr1:71717172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C83
`Chr1:71717190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B34,C45,C5
`Chr1:71717222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:71717227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B109,B36,C82
`Chr1:71717251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B114,B122,B53,B62
`Chr1:71717270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:71717283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788875.1

795 aa

398

795

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 491-706 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 492-771 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788875.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	491	706	3.5e-41	142.1	Protein kinase domain
`XP_057788875.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	492	771	9.6e-43	147.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932892.1
TTTTAAATACAAATAAAGCACGAGAATTGAGAAAAAAAAGAGAAAAGTCTTGGGGGAAAAATAGAAAATAAAAGAAGAAATTTGACTGAAAGTTCCTAATTAGCCTATCTTCCCTTCCTTCTCCGAAGACCAGCTTACATTTTCTCAGCTGGTCAAACAACATACACAGTAACACTGAATCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCAAATGAGGGGGGCACTTGAAGAACTCCATAGATGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005805
ATGACGAAACCCTTTTCAGCCGTCATCTCCGCCGCGATACTATTCCTCGTCGCCCTGACCTCCCCGCCGCCGGCGTCCGCCCTCGGTGGCTCCGCCGCCACCGTCGCCGCCGTGTACGGCTCCTCCACCACCGTATGTTCCATTGCCGCCAACCAAGCCATCCAGCAAATCCAATGCTGGAGTGATGGCCAATTACTGCCCCCAATCCTCCCCACCACCTCCTTCGACTACCTCTCCGGCGGCCGCGACACCCTCTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788875.1
MTKPFSAVISAAILFLVALTSPPPASALGGSAATVAAVYGSSTTVCSIAANQAIQQIQCWSDGQLLPPILPTTSFDYLSGGRDTLCAVRSRGFSLLCWNTTFDPKRIYNTSSAPLTSLAIGDTQICALRNTTGGENAICWRGNDVSPAQFPDRFRMVSSGLRFSCGVVEASGRVLCWGGDGGGGGVTSSSIQSEFANFSMFNIHVGGSHACGISNSGIVICRGSNDDGQLNIPSNTSGDYRDLALGANHTCAIRRSNGAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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