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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005478`

染色体: Chr01 坐标: 71767146-71770548 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005478`
名称	SmilChr01G005478
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71767146 - 71770548 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005810`
GeneID	`131005810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005810`
原始查询	`LOC131005810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-4-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-4-like
Arabidopsis	`AT3G55920` (AT3G55920) Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824758] identity=64.9; qcov=0.996; evalue=5.63e-98; confidence=high
Rice	`Os06g0708500` (OsCYP20-1) - identity=65; qcov=0.973; evalue=3.99e-93; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0006457 (protein folding); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057788884.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057788884.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057788884.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788885.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788885.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71767391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B125,B90,B92,D6
`Chr1:71767590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B108,B24,B82
`Chr1:71768685`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr1:71768685`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr1:71769750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D6
`Chr1:71769774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B76,C82
`Chr1:71769825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C67,C71
`Chr1:71769833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B103,B2,B23,B97
`Chr1:71769833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B2,B23,B97
`Chr1:71769890`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A8,B5,B72,B98
`Chr1:71769890`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A8,B5,B72,B98
`Chr1:71770080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788884.1

230 aa

115

230

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 64-223 aa

XP_057788885.1

226 aa

113

226

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 64-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788884.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	64	223	4.4e-47	161.0	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057788885.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	64	219	4e-41	141.6	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932902.1
GCAATGAATCAAAATTCCACTCAAACTTGATAATTTTAGTGGCAATTACTACTATAATGAATTTCTTGTTTTTACTTTTCTCAGAGTCTTAACAGTGACAGTCGATCAATTTTTTTTAACTGCAGTTAAAAAACATTCTCTTCTCCCTCAAATTGAAACCAAATAACGCCTCCATCAAAGCGTTCCAAATCTTTCTTCCTCTTTCCCTGCGCTACTCGATTCTTGAATGGTGAGATGGCCAACACCAGAAGATTACTCCC...

XM_057932901.1
GCAATGAATCAAAATTCCACTCAAACTTGATAATTTTAGTGGCAATTACTACTATAATGAATTTCTTGTTTTTACTTTTCTCAGAGTCTTAACAGTGACAGTCGATCAATTTTTTTTAACTGCAGTTAAAAAACATTCTCTTCTCCCTCAAATTGAAACCAAATAACGCCTCCATCAAAGCGTTCCAAATCTTTCTTCCTCTTTCCCTGCGCTACTCGATTCTTGAATGGTGAGATGGCCAACACCAGAAGATTACTCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005810
ATGGCCAACACCAGAAGATTACTCCCCATTGTGATTTTGTGGATTGTCATTCTGTTTGGCACCCTTGCTCTGATTCTGAATCGGTTAAGCGATCCAGGAGCTTCATCGGAGCATAATTCTGCTGTAGATGAAAAGCTTGTCAACGAGGTGGGATTATCGGAGGATGCAGATCAAGTGACGCATAAAGTTTACTTTGACATTGAAATTAATGGGAAGCACATAGGTCGCGTTGTGATGGGGCTCTATGGAAAAACTGTGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788884.1
MANTRRLLPIVILWIVILFGTLALILNRLSDPGASSEHNSAVDEKLVNEVGLSEDADQVTHKVYFDIEINGKHIGRVVMGLYGKTVPRTAENFRALCTGEKGTGTSGKALHFKGSKFHRIIPSFMIQGGDFTRGDGWGGESIYGDKFPDENFKLKHAGPGVLSMANSGVDTNGSQFFITTVKTSWLDGRHVVFGQVVSGMDVVKKIEALGTESGMPKATVVVSDSGELSV

XP_057788885.1
MANTRRLLPIVILWIVILFGTLALILNRLSDPGASSEHNSAVDEKLVNEVGLSEDADQVTHKVYFDIEINGKHIGRVVMGLYGKTVPRTAGKISREKGTGTSGKALHFKGSKFHRIIPSFMIQGGDFTRGDGWGGESIYGDKFPDENFKLKHAGPGVLSMANSGVDTNGSQFFITTVKTSWLDGRHVVFGQVVSGMDVVKKIEALGTESGMPKATVVVSDSGELSV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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