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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005485`

染色体: Chr01 坐标: 71807701-71810985 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005485`
名称	SmilChr01G005485
描述	deoxyhypusine hydroxylase-B
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71807701 - 71810985 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005818`
GeneID	`131005818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005818`
原始查询	`LOC131005818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deoxyhypusine hydroxylase-B
产物	deoxyhypusine hydroxylase-B
Arabidopsis	`AT3G58180` (AT3G58180) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824987] identity=76.2; qcov=1.01; evalue=3.98e-167; confidence=high
Rice	`Os12g0163300` - identity=77.9; qcov=0.984; evalue=2.01e-163; confidence=high
GO	GO:0008612 (peptidyl-hypusine biosynthetic process); GO:0019135 (deoxyhypusine monooxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03130 (HEAT_PBS); PF13646 (HEAT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788895.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788895.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788895.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788895.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71808219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:71809620`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:71809620`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:71809697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C38,C52,C70
`Chr1:71809973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:71810576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788895.1

308 aa

154

308

HEAT_2

HEAT_PBS

HEAT_2

HEAT_PBS

HEAT_2

HEAT_PBS

PF13646 HEAT_2 49-134 aa PF03130 HEAT_PBS 62-87 aa PF03130 HEAT_PBS 94-118 aa PF13646 HEAT_2 166-238 aa PF03130 HEAT_PBS 182-205 aa PF13646 HEAT_2 211-284 aa PF03130 HEAT_PBS 212-238 aa PF03130 HEAT_PBS 245-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF13646`	HEAT_2	Repeat	49	134	2.5e-38	131.0	HEAT repeats
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF03130`	HEAT_PBS	Repeat	62	87	3.9e-24	83.1	PBS lyase HEAT-like repeat
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF03130`	HEAT_PBS	Repeat	94	118	3.9e-24	83.1	PBS lyase HEAT-like repeat
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF13646`	HEAT_2	Repeat	166	238	2.5e-38	131.0	HEAT repeats
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF03130`	HEAT_PBS	Repeat	182	205	3.9e-24	83.1	PBS lyase HEAT-like repeat
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF13646`	HEAT_2	Repeat	211	284	2.5e-38	131.0	HEAT repeats
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF03130`	HEAT_PBS	Repeat	212	238	3.9e-24	83.1	PBS lyase HEAT-like repeat
`XP_057788895.1`	Pfam	`PF03130`	HEAT_PBS	Repeat	245	271	3.9e-24	83.1	PBS lyase HEAT-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932912.1
TTGTTATATTTATAGCTTATTTCAAGTTTTTTTAAAAAAATCATAGTACTAAAAAACATCACATGCATGCTAAAAAAATCGGTTTTATGAGTTCGATTCGACTTAGGATCGAAACCGCCCGGATTGCTCAGTAGAGCAATTTTAAACCCTAATTTCTAGCAATTAGGGCTTTTCCGCGGCAAAATCACGCTACTGTGATCAATTTTAAACCCTGATTTATAAAGGTTGGGGCTTTTCGCAGAGCAATTTACAAATGGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005818
ATGGATAGCGAACGTTCGTTCAAAGTGCCGCCGGAAACGGAGAGGTTTCTCTGCGAACGGTTGTTGGATGAAAAGCAGCCCATCTCAGAGCGATTTAGAGTCCTATTTTCTCTCCGCAACCTCCGTGGCGCCGCACCCCGCAATGCGCTCATCAAAGCAACTAGGGATACTTCAAACCTGCTTGCACACGAGGCGGCATTTGCTTTGGGTCAGATGCAAGATGCTGAAGCTATCCCTGCATTAGAAGCTGTTCTAAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788895.1
MDSERSFKVPPETERFLCERLLDEKQPISERFRVLFSLRNLRGAAPRNALIKATRDTSNLLAHEAAFALGQMQDAEAIPALEAVLNDLSLHPIVRHEAAEALGAIGLECNAALLKSSLASDPAQEVRETCELALSRIDGLKNTSVSETSPFLSVDPAAPAACSSVEELREVLLNEDKSMYERYAALFALRNLGRDEAVSAIVESLGADSALLRHEVAYVLGQLQNKKASDALSQVLRDVNEHPMVRHEAAEALGSIADEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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