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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005498`

染色体: Chr01 坐标: 71879521-71881653 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005498`
名称	SmilChr01G005498
描述	probable aquaporin PIP1-4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71879521 - 71881653 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005834`
GeneID	`131005834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005834`
原始查询	`LOC131005834`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aquaporin PIP1-4
产物	probable aquaporin PIP1-4
Arabidopsis	`AT4G00430` (PIP1;4) plasma membrane intrinsic protein 1;4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827956] identity=89.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0559700` (OsPIP1) - identity=89.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009414 (response to water deprivation); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0015250 (water channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788915.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788915.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788915.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788915.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788915.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71879943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B86,B9,C55
`Chr1:71879955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:71879961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C83
`Chr1:71880048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:71880096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C62
`Chr1:71880120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B58,C11,C20,C69
`Chr1:71880370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:71880388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:71880418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B86,B9,C55
`Chr1:71880433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C41,C49
`Chr1:71880436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B37,D3
`Chr1:71880541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C41,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788915.1

286 aa

143

286

MIP

PF00230 MIP 45-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788915.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	45	274	1.6e-84	283.8	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932932.1
CTCATTTTGCCAGCTGGGCTGCCCACGTCGCTTTCACTAACCCAACCAAAATTCAAGAACTACACTTTGCACAAATAGGAATATATCAAGAAATAAAAACTCTTGCATGATTGATGGTCGGTTTGTATCATAATGAAAAAATAAAATAAAATTAAGTCATCAATGGAGCTCGATGGGCCCCCCTCTCCTATCCTCACTATTCCTCTATATAAATATATCATCATCACCCTCCCACTTTCATCCAACCACCACTCACTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005834
ATGGAGAACAAGGAGGAGGATGTTCGAGTGGGAGCCAACAAGTTCCCGGAGCGCCAGCCCATCGGCACGGCGGCGCAGACTCAGGACAAGGACTACAAGGAGCCGCCGCCGGCGCCGCTCTTCGAGCCCGGCGAGATCACCTCGTGGTCGTTCTACAGAGCCGGGATTGCCGAATTCATCGCGACTTTCCTCTTCTTGTACATCAGCATCCTCACCGTCATGGGCGTTCAGAACTCCCCGTCCAAGTGCGCCACCGTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788915.1
MENKEEDVRVGANKFPERQPIGTAAQTQDKDYKEPPPAPLFEPGEITSWSFYRAGIAEFIATFLFLYISILTVMGVQNSPSKCATVGIQGIAWAFGGMIFALVYCTAGISGGHINPAVTFGLFLARKLSLTRAVFYMVMQCLGAICGAGVVKGFHKTLYMTKGGGANVVNHGYTKGDGLGAEIVGTFVLVYTVFSATDAKRSARDSHVPILAPLPIGFAVFLVHLATIPITGTGINPARSLGAAIIYNKDAAWNDHWIFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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