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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005569`

染色体: Chr01 坐标: 72469292-72527121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005569`
名称	SmilChr01G005569
描述	7-deoxyloganetic acid glucosyl transferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72469292 - 72527121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005889`
GeneID	`131005889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005889`
原始查询	`LOC131005889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	7-deoxyloganetic acid glucosyl transferase-like
产物	7-deoxyloganetic acid glucosyl transferase-like
Arabidopsis	`AT1G22380` (UGT85A3) UDP-glucosyl transferase 85A3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838845] identity=39; qcov=0.992; evalue=1.01e-117; confidence=medium
Rice	`Os07g0486700` - identity=40.5; qcov=0.986; evalue=9.26e-117; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00201 (UDPGT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788985.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788984.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788984.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788984.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788984.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72469399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D3,D9
`Chr1:72469410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:72469420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:72469456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72469485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72469514`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr1:72469514`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr1:72469529`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B37,B52,C20
`Chr1:72469529`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B37,B52,C20
`Chr1:72469570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B130,B90,D11
`Chr1:72469595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B81,B86,C26,C75
`Chr1:72469627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B104,C4,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788984.1

538 aa

269

538

UDPGT

PF00201 UDPGT 350-478 aa

XP_057788985.1

486 aa

243

486

UDPGT

PF00201 UDPGT 292-439 aa

XP_057788986.1

485 aa

242

485

UDPGT

PF00201 UDPGT 291-438 aa

XP_057788987.1

484 aa

242

484

UDPGT

PF00201 UDPGT 292-439 aa

XP_057788988.1

483 aa

242

483

UDPGT

PF00201 UDPGT 291-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788984.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	350	478	3.6e-23	82.9	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
`XP_057788985.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	292	439	1.9e-27	97.0	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
`XP_057788986.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	291	438	1.9e-27	97.0	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
`XP_057788987.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	292	439	1.9e-27	97.0	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
`XP_057788988.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	291	438	1.9e-27	97.0	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933001.1
CTGCCGCCGCACGTGGTGATTTTCCCATTTCCGGCGCAGGGCCACATGAATTGCATGCTCAATCTCGCTCATCTCTTCTGCTTAACCGACTTCCACGTCACCTTCATCGTGTCGGAATTCAGCCACCGCCTCCTCCTCAGCAACACCTCCGTCCCCGCCACCTTCGCCGCCTATCCCGGCTTCCAGTTCCGGAGCATCCCCGACGGCCTCCCCGACCACCACCCCCGCTCCGGTGCAAAAGTAGCCGATGTCGTTCCCGC...

XM_057933005.1
GCCACATTATAGTGCTCTGTTTTAAAAGGGACATTTTTATACTTTTTTGCTTTGTTTTTTAATGTAAGAAGCATTATTCTACTTCATGAGATTCCATCCATCAATATTTCAATGGTTCATTAAATCTATGAATGCATATAAACAGTTACAGTCATTCGAGGATTTTGAATAATCCAAAATATCAAATATTATGAGTTCCAAATTAGAAGAGGAGCTGCCGCCGCACGTGGTGATTTTCCCATTTCCGGCGCAGGGCCACA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131005889
ATGTTGATGATCTCATTCAAGCTCAAGAAATTCCCATCAATGTGGAATAAGCGGTGGACATCAAAAGTGGGACAACAAAATTTGTCATTCATTTCATCTATAAATTGCAATACTCAGAAGTCAGAAACGAAAACAAAAGCCATTAAATTGGAAGTTCAGAATTGGAAGAAGATGAGCTGTGAAGAAGGAAAAGACCTGCCACCGCACGTGCTGATTTTCCCTTATCCAGTTCAGGGGCATCTCAACTCCATGCTCAATCT...

LOC131005889
ATGAGTTCCAAATTAGAAGAGGAGCTGCCGCCGCACGTGGTGATTTTCCCATTTCCGGCGCAGGGCCACATGAATTGCATGCTCAATCTCGCTCATCTCTTCTGCTTAACCGACTTCCACGTCACCTTCATCGTGTCGGAATTCAGCCACCGCCTCCTCCTCAGCAACACCTCCGTCCCCGCCACCTTCGCCGCCTATCCCGGCTTCCAGTTCCGGAGCATCCCCGACGGCCTCCCCGACCACCACCCCCGCTCCGGTGC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057788984.1
MLMISFKLKKFPSMWNKRWTSKVGQQNLSFISSINCNTQKSETKTKAIKLEVQNWKKMSCEEGKDLPPHVLIFPYPVQGHLNSMLNLAHLFCLSDFHVTFIISDFNHRRLLEHTTVPAAFARYPGFQFRTLPDGLPDDHPRTGERALDLIFSIEKVTVPLFKKLIVQENFLGGAARRRVTCFVADAMSFAPAFAREHQLPLIIFHTTSASFSWALLCFPQLLQAQDIPFRGKSMDELVKSVPGMEGFLRRRDLPSFYRAD...

XP_057788985.1
MSSKLEEELPPHVVIFPFPAQGHMNCMLNLAHLFCLTDFHVTFIVSEFSHRLLLSNTSVPATFAAYPGFQFRSIPDGLPDHHPRSGAKVADVVPAVTSHMVPLFKKMMAEEGFLASPHRRPATCFVADGFFTFAVDFAEENGIPLIYFRTPSASYFWAYFHVDDLIQAQEIPINAEKSMDLLVKGIPGMEGFLRRRDLPGFFRTYDLNEPLLQSLAVATKQIVRAQAVIFNTFDDLEGPIVSLMLEKLPRIYTIGPIHEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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