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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005527`

染色体: Chr01 坐标: 72138861-72141690 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005527`
名称	SmilChr01G005527
描述	uncharacterized SmilChr01G005527
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72138861 - 72141690 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005898`
GeneID	`131005898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005898`
原始查询	`LOC131005898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824512]; symbol=AT3G53440; hit=AT3G53440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824512]; symbol=AT3G53440; hit=AT3G53440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G53440` (AT3G53440) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824512] identity=45.5; qcov=0.508; evalue=1.38e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0581900` - identity=39.6; qcov=0.096; evalue=8.68e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789001.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789001.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789001.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789001.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72139256`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B101,B140,B78,C71,C75,C8,C82
`Chr1:72139263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:72139273`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A6,B130,B136,B28,B5,B6,B93,C39,C46,C47,C49,C63,C84
`Chr1:72139276`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A6,B130,B136,B28,B5,B6,B93,C39,C46,C47,C49,C63,C84
`Chr1:72139298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:72139384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C49
`Chr1:72139395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C75,C8,C82
`Chr1:72139443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C8
`Chr1:72139479`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr1:72139479`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C41
`Chr1:72139486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr1:72139879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C75,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933018.1
TATTGATTAATTACTAAGTGCAGCCGTCTATTTTACTTTAAATACATTTCTGTTTTCTTATTAAAAGAGAACGCTTATAAAAAAATAAAAATAAAAAAATGCTTAGGGTTTCCTATAAAAGTCTTCCTTCCTTCAAAAAATATAACGTCTCTCTTTTCCCGCTTTCTCGCCATCTGTCTAATTCTGAGGTGAAGAAGCTGCAGACCTTCTGTTTGAAGAAATGCCGAAGAGAGAATCCAAGGAAATCGTAGAGGAAACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005898
ATGCCGAAGAGAGAATCCAAGGAAATCGTAGAGGAAACACCCACCATTTCTCTTAGAAGATCCACCAGAATTCACCGTCAAAATCAAACCGGAGCTCAGAGCCCAAGGACTCCAAAGCCTGCTGGAACGAGACGCGATTCAATTCCCACACCTATTTCCAAAATCAAGAAAACTGGCCATAGGGTTTCAGAGAACAGAAGGGGGAGAGAGATCGAGTTTGATTCGGAGAAATTCAGGAGTAGAAGCCCGGATTTAGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789001.1
MPKRESKEIVEETPTISLRRSTRIHRQNQTGAQSPRTPKPAGTRRDSIPTPISKIKKTGHRVSENRRGREIEFDSEKFRSRSPDLGKQSVKEKRQTRSSVARCRSVGGSEKSGEGSRRSGRANTGKEEVVEKMLTRSSARRNKVGDSNLNTEESDVKFEKMVTRSSSKAEMKKVSNVPKGGDELPERDTRDKDVEDCGIMKRNGEQNRARKARIGGKRKRDGVEGVCEDARGWTEDQELHLQSAYFSVKPTPHFWKKVAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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