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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005705`

染色体: Chr01 坐标: 73285475-73291615 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005705`
名称	SmilChr01G005705
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73285475 - 73291615 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005920`
GeneID	`131005920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005920`
原始查询	`LOC131005920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase-like
Arabidopsis	`AT3G55430` (AT3G55430) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824709] identity=56.2; qcov=0.973; evalue=5.13e-174; confidence=high
Rice	`Os11g0704600` - identity=50.3; qcov=0.98; evalue=2.74e-153; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057789024.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057789024.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789024.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789024.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73285756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C55
`Chr1:73285825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B117,B72
`Chr1:73285843`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A13,A19,A2,A23,B102,B112,B114,B118,B120,B13,B21,B48,B65,B66,B75,B87,B96,B99,C32,C35,C44,C45,C50,C53,C55,C68,D11,D3,D4
`Chr1:73285847`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A13,A19,A2,A23,B102,B112,B114,B118,B13,B21,B48,B66,B75,B87,B96,B99,C32,C35,C44,C50,C53,C55,C68,D11,D3
`Chr1:73285848`	`TCG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B17,B53,C2
`Chr1:73285892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C53
`Chr1:73285904`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C44,C79
`Chr1:73285904`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C44,C79
`Chr1:73285906`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A13,A19,A2,A23,B102,B112,B118,B13,B17,B21,B53,B66,B75,B87,B96,B99,C2,C32,C35,C44,C45,C50,C53,C55,C68,D11,D3
`Chr1:73285908`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C76
`Chr1:73285908`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C76
`Chr1:73285916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789024.1

450 aa

225

450

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 24-337 aa PF07983 X8 364-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789024.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	24	337	1.6e-72	245.5	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057789024.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	364	434	1.5e-21	77.5	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933041.1
CATTCAGCAATCTTACAACCAATCTTACTACAAAATCTCATTAATTATTACACATCTCATTCCCATTTCCCACTACGCGTTTTTCTCTTCACACCCATAATTTTTCATTAAATTTCAACAAATCCAATAAAAATCTCAATTTCACTTCACAGTTAAAAAAAGCCGCAGCCCTTCTCCAAATTCCACCTCACCACACACATCTCAGCTTCACCTTCTTCCCCAATGGCCCCCCCCAGCCCCCTCCTCCTCCGCCTCCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005920
ATGGCCCCCCCCAGCCCCCTCCTCCTCCGCCTCCTCCCCCTCCTCGCCCTCCTCTCCGCCGCCTCCGCCATCGGCGTCAACTACGGCACCCTCGGCGACAACCTCCCCCCTCCGGCGCAGGTCGCCCAGTTCCTCAAGGACAAAACCACCATCGACCGCGTCAAAATCTTCGACACCAACCCCGACATCCTCCGCGCCTTCGCCGGCACCGGCATCCTCGTCGCCGTCACCGTCCCCAACGGCGAGATCCCCGCCCTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789024.1
MAPPSPLLLRLLPLLALLSAASAIGVNYGTLGDNLPPPAQVAQFLKDKTTIDRVKIFDTNPDILRAFAGTGILVAVTVPNGEIPALTAPSYARSWVASHIAPFHPQTAINYILVGTEVLHWGPQPLVDALVAAMRSLHSALKQSNLTSIKVTTAHSLGILESSSPPSLARFRPGWAEGVLAPLLQFHRDAKTPFMVNPYPYFGYSPQNADFALFKPNKGTFDKFTKRTYGNMFDMLMDAVYVSMMKLGYKDVEIAVGETG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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