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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005658`

染色体: Chr01 坐标: 72929350-72930925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005658`
名称	SmilChr01G005658
描述	aspartic proteinase PCS1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72929350 - 72930925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005922`
GeneID	`131005922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005922`
原始查询	`LOC131005922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase PCS1-like
产物	aspartic proteinase PCS1-like
Arabidopsis	`AT2G39710` (AT2G39710) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818555] identity=62.2; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0844500` - identity=56.4; qcov=0.93; evalue=4.72e-157; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057789025.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057789025.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789025.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789025.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72929440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C14,C15,C46,C80,D11
`Chr1:72929461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:72929602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B27,B67
`Chr1:72929719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:72929841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:72929905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:72929930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:72929974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:72930004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D11
`Chr1:72930057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C28
`Chr1:72930058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:72930241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789025.1

446 aa

223

446

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 72-238 aa PF00026 Asp 73-434 aa PF14541 TAXi_C 266-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789025.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	72	238	3.5e-39	135.5	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057789025.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	73	434	4.7e-15	56.5	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057789025.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	266	432	3.3e-32	112.2	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933042.1
AAATTAACAACCGTCACTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTATTATATATAAAATATTTCACTCGTTTGGTTTCATTAGGTGAGTGAAACTTTATTATATACACACATCACATTATAAATTTATAATTTACGTACCAAAATTTTAAAATATAAAGATGGCAAAACACACACTTCCTCAGCTAGATATCGCACAGTGCGCGAGAGCCATGAATCTCGTCGCGGCGGTAATCATCCTATGCTGCGCGGTGCTGATGCACCCCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005922
ATGGCAAAACACACACTTCCTCAGCTAGATATCGCACAGTGCGCGAGAGCCATGAATCTCGTCGCGGCGGTAATCATCCTATGCTGCGCGGTGCTGATGCACCCCTCTTCATCGCAGCAGCAATCACTGATCCTCCCCCTCAAAGCCACGCAACTCCCGCCGCCGCCGCGCCCCTCCAACAAGCTCTCCTTCCACCACAACGTCTCCCTCACCGTCGCCGTCGCCGTCGGCACGCCGCCGCAGGCGGCCACCATGGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789025.1
MAKHTLPQLDIAQCARAMNLVAAVIILCCAVLMHPSSSQQQSLILPLKATQLPPPPRPSNKLSFHHNVSLTVAVAVGTPPQAATMVLDTGSELSWLHCRKTPAAPLAFAPALSASYRPTPCSSPTCTARTRDFPVPASCDAAKLCHAVISYADASSVEGNLAADNFHLDGSGSGSNSYPGMIFGCMDSGSSSNPEDLKTTGLIGMNRGGLSLVSQTGFKKFSYCISGRDSSGVLLFGDADFPWLAPLNYTPLVQMSTPLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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