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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005639`

染色体: Chr01 坐标: 72826218-72828525 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005639`
名称	SmilChr01G005639
描述	protein phosphatase 2C 37-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72826218 - 72828525 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005924`
GeneID	`131005924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005924`
原始查询	`LOC131005924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase 2C 37-like
产物	protein phosphatase 2C 37-like
Arabidopsis	`AT3G11410` (PP2CA) protein phosphatase 2CA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820314] identity=61.7; qcov=0.885; evalue=3.35e-145; confidence=high
Rice	`Os01g0846300` (OsPP15) - identity=61; qcov=0.776; evalue=7e-128; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789027.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789027.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789027.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789027.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789027.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72826719`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:72826719`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72826776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:72826786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:72826788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:72826867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B130,B71,D11
`Chr1:72826957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C46
`Chr1:72826968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C52,C83
`Chr1:72826985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C52,C83
`Chr1:72827105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:72827128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C21,C48
`Chr1:72827179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B56,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789027.1

416 aa

208

416

PP2C

PF00481 PP2C 116-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789027.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	116	363	8.4e-63	213.1	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933044.1
AAATTTCCCACAAAATAAAATAAAAATAAAAATAACACAAAAAAAGCGAATAACAACCCACGGGACTGCTTCGACCCACATGCGTGTCAGTAAAGGAAGGCCCCCACCTCACCCCCCTCGTGCTCGCTTCCCATTCGTCCACGTATCCTCCCTCCTCTTCTCCCCGACACGTGTCTCCCTGATCGACGGCCCAGATCCCCCCTCTCGCATTCAGCGTCTCTACGTCACACCAACTGTTAGTGTCGGATCATTCATTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005924
ATGGCTGGAATGTGCTGTGAAGTGAATCTCGCTGAGACGGAGACGTCTGCACCGGTGCAGCCGACCTCGAGGTCCGCCAGGAGGAGGAGGATGGAAATCCATCAGTTCAAGTTCGTCCCCACCGATTCCGCGGTGGCGCCGCCGCTCGACGGCCGCGGGAAGAGGAAGCGCCAGAGATGCGATGCCGTTGTTCCGGTTTTGCCGCCTAGAGAGTGCGAGGTCGCCGCTCGGAGCTGTGAGAAGTTGAATAAGCTCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789027.1
MAGMCCEVNLAETETSAPVQPTSRSARRRRMEIHQFKFVPTDSAVAPPLDGRGKRKRQRCDAVVPVLPPRECEVAARSCEKLNKLAGEVEPEAKQLRVSASAVATEAEVAPDFPKFGMTSVCGRRRDMEDAVAIHPSFSGLSPNFPSGMHFFGVYDGHGCSHVATKCRDRMHEIVKDELQTGGSSSWERVMCESFSKMDKEVGDCSSGRDSTCCVSACRCELQTPQCDAVGSTAVVAVVTPDKIVVSNCGDSRAVLCRNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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