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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005558`

染色体: Chr01 坐标: 72395385-72398199 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005558`
名称	SmilChr01G005558
描述	uncharacterized SmilChr01G005558
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72395385 - 72398199 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005926`
GeneID	`131005926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005926`
原始查询	`LOC131005926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469]; symbol=AT5G05840; hit=AT5G05840; species=arabidopsis; confidence=high
产物	replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469]; symbol=AT5G05840; hit=AT5G05840; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05840` (AT5G05840) replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469] identity=64.7; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0267500` - identity=60.9; qcov=1; evalue=2.12e-170; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04788 (DUF620)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789030.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789030.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789030.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789030.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72395652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:72395690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B7,C47
`Chr1:72395729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:72395934`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A23,B1,B28,B59,B7,B75,B80,B83,B97,C11,C39,C47,C5,C69,C74
`Chr1:72395937`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A23,B1,B28,B59,B7,B75,B80,B83,B97,C11,C39,C47,C5,C69,C74
`Chr1:72395946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:72395997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:72396019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B20,B71,C54,C6
`Chr1:72396065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr1:72397055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:72397082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:72397085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B71,C29,C78,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789030.1

402 aa

201

402

DUF620

PF04788 DUF620 120-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789030.1`	Pfam	`PF04788`	DUF620	Domain	120	365	9.3e-122	405.8	Protein of unknown function (DUF620)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933047.1
CTCTATTTCTTCACATACAAATTCTCTCAAATCCTTTCTCCCACTCCTAGCTACTTCCCACCATTCCCCTCTCTCCTTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCACTACAATGAGAACTTTGTGTCCGAATTTGGACCGGGAAGACGGCCTCGACACGGTGCTGGAGGTTCCGATCCCGGAGGAAATGCTCGCTTCCAGCAAGCACACGTCGTGGCAGAGCATGAAGTCGTGGATGACGCGGCCCGCCGCGGCCGCCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005926
ATGAGAACTTTGTGTCCGAATTTGGACCGGGAAGACGGCCTCGACACGGTGCTGGAGGTTCCGATCCCGGAGGAAATGCTCGCTTCCAGCAAGCACACGTCGTGGCAGAGCATGAAGTCGTGGATGACGCGGCCCGCCGCGGCCGCCGCCGCCTCCGTCTTTGGCGGCCGCGCCGCCGAGATTCAGTTCCTGCTCGGAGTCGTCGGAGCCCCCCTCATACCCCTGCCCATCCGCTGCGACCGCACCGTCAACAACAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789030.1
MRTLCPNLDREDGLDTVLEVPIPEEMLASSKHTSWQSMKSWMTRPAAAAAASVFGGRAAEIQFLLGVVGAPLIPLPIRCDRTVNNNIKGCPIESSMAKYIVQQYIAAAGGEHALNGIDSMYAMGKVKMAASEFVSGDAKVKNMARHGAGEMGGFVLWQKRPDLWSLELMVAGYKISAGSDGKVAWRQTPWQNSHASRGPPRPLRRSLQGLDPRSTANLFSNSICIGEKSINGEDCFVLKLEAEAPTLRARSSSNVEIMRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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