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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005720`

染色体: Chr01 坐标: 73382831-73385569 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005720`
名称	SmilChr01G005720
描述	actin-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73382831 - 73385569 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005937`
GeneID	`131005937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005937`
原始查询	`LOC131005937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-like
产物	actin-like
Arabidopsis	`AT3G12110` (ACT11) actin-11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820385] identity=95.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0718100` (ACT1) - identity=96.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057789041.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789041.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057789041.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789041.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73384112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:73384430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:73384616`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	200	A10,A13,A14,A19,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B4,B40,B41,B43,B44,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C29,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:73384623`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	200	A10,A13,A14,A19,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B4,B40,B41,B43,B44,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C29,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:73384755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C82
`Chr1:73384773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D10
`Chr1:73385258`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A20,B107,B111,B118,B121,B128,B14,B140,B3,B43,B44,B45,B50,B51,B57,B64,B66,B70,B72,B77,B89,C12,C14,C31,C35,C39,C48,C50,C6,C66,C86,C87,C9,D8
`Chr1:73385268`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A20,B111,B118,B128,B14,B140,B3,B43,B44,B50,B51,B57,B64,B72,B77,C12,C31,C50,C6,C86,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789041.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 5-377 aa

XP_057789042.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 5-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789041.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	377	2.3e-146	488.3	Actin
`XP_057789042.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	5	377	2.3e-146	488.3	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933058.1
CTCCCTCTTCCAAGACGGCTCCATCGTCTCTCTCACTCACTCTACAACACCTCCTGCGTTGCGTTTCCGGAAGTATTAGAACTAGTGTAACATGGCAGAAGCAGATGACATTCAGCCACTCGTCTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGATTTGCCGGGGATGATGCCCCGCGAGCTGTGTTTCCCAGCATTGTTGGTCGGCCCCGTCACACCGGTGTGATGGTGGGCATGGGCCAAAAAGATGCATATGTTG...

XM_057933059.1
CCAAGACGGCTCCATCGTCTCTCTCACTCACTCTACAACACCTCCTGCGTTGCGTTTCCGGAAGAACTAGTGTAACATGGCAGAAGCAGATGACATTCAGCCACTCGTCTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGATTTGCCGGGGATGATGCCCCGCGAGCTGTGTTTCCCAGCATTGTTGGTCGGCCCCGTCACACCGGTGTGATGGTGGGCATGGGCCAAAAAGATGCATATGTTGGTGATGAAGCTCAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005937
ATGGCAGAAGCAGATGACATTCAGCCACTCGTCTGCGACAATGGAACTGGAATGGTTAAGGCTGGATTTGCCGGGGATGATGCCCCGCGAGCTGTGTTTCCCAGCATTGTTGGTCGGCCCCGTCACACCGGTGTGATGGTGGGCATGGGCCAAAAAGATGCATATGTTGGTGATGAAGCTCAGTCGAAGAGAGGTATCTTGACTCTAAAGTACCCCATTGAACATGGTATCGTCAACAACTGGGACGATATGGAGAAGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789041.1
MAEADDIQPLVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVNNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNAPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYSLPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTSAEREIVRDMKEKLSYIALDYEQELETGKTSSAVEKSYELPDGQVITIGNERFRCP...

XP_057789042.1
MAEADDIQPLVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVNNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNAPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYSLPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTSAEREIVRDMKEKLSYIALDYEQELETGKTSSAVEKSYELPDGQVITIGNERFRCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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