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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005723`

染色体: Chr01 坐标: 73393875-73397842 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005723`
名称	SmilChr01G005723
描述	uncharacterized SmilChr01G005723
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73393875 - 73397842 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005950`
GeneID	`131005950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005950`
原始查询	`LOC131005950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818546]; symbol=AT2G39630; hit=AT2G39630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818546]; symbol=AT2G39630; hit=AT2G39630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39630` (AT2G39630) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818546] identity=74.1; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0821800` - identity=74.1; qcov=0.863; evalue=1.56e-157; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00535 (Glycos_transf_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057789058.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057789058.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057789058.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789058.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73394318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:73394357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B40,C62,C82
`Chr1:73394716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr1:73395085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:73395088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:73395109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:73395289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B44
`Chr1:73395295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B27
`Chr1:73395311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:73395333`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A8,B111,B124,B127,B138,B27,B31,B63,B65,B82,B83,B93,B95,B97,C20,C35,C46,C73,D9
`Chr1:73395715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:73395901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789058.1

336 aa

168

336

Glycos_transf_2

PF00535 Glycos_transf_2 70-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789058.1`	Pfam	`PF00535`	Glycos_transf_2	Domain	70	183	7.4e-24	85.3	Glycosyl transferase family 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095369.1
AGTAATTAACCAACAAGTTGTTAAGTAGTTGAAGAAAAAAGTAAACTGATACAAACATTTCTTCAAAGTTCACTTGCTCAATTTCAACGAAGGCAATCCAAATTATGTAATTAAACAATTCAGAATTGGGAGTATATCTTTCAAACCCTAGGCGCGAGCCTTGACTTAGCCATTAGCTAAATTAGCTAAACTGGCAGATCGATTGATTACTATAATCGAGTTGAATTCCTGATTTATTGGAAAAAAATTCTAGGATTTTG...

XM_057933075.1
AGTAATTAACCAACAAGTTGTTAAGTAGTTGAAGAAAAAAGTAAACTGATACAAACATTTCTTCAAAGTTCACTTGCTCAATTTCAACGAAGGCAATCCAAATTATGTAATTAAACAATTCAGAATTGGGAGTATATCTTTCAAACCCTAGGCGCGAGCCTTGACTTAGCCATTAGCTAAATTAGCTAAACTGGCAGATCGATTGATTACTATAATCGAGTTGAATTCCTGATTTATTGGAAAAAAATTCTAGGATTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005950
ATGGGATTCATTTGGGCGTTGTTTGAATCCCTAGCGATCGTGGCATCAGTTTTGGCGTTTGGATTGTTGGCGGCCATCGTTTTCGCCTCGTTCAGAAGAAAGCACAGTCACAACTGTCACGTAGAGGCGCCGCCAGTTTTCGAGGATCCGAATTCTTTGAAATCGGTTCCTTGTCCCCATATCGTCGATCCTGCTGAAAAGTACATATCTTTGATAATTCCAGCATACAACGAAGAGCACAGACTTCCAGGGGCTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789058.1
MGFIWALFESLAIVASVLAFGLLAAIVFASFRRKHSHNCHVEAPPVFEDPNSLKSVPCPHIVDPAEKYISLIIPAYNEEHRLPGALDETLNYLEDRAAKDKSFSYEVIIVDDGSADGTKRVAFDFVKRYTVENVRVVLLGRNHGKGEAIRKGMLHSRGELLLMLDADGATKVSDLEKLENQIHAVAAKEQKYGDSTSSDATLRISDVPIAAFGSRAHLEEKALASRKWYRNFLMKGFHLVVLLAAGPGIRDTQCGFKMFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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