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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005608`

染色体: Chr01 坐标: 72613265-72616085 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005608`
名称	SmilChr01G005608
描述	uncharacterized SmilChr01G005608
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72613265 - 72616085 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005951`
GeneID	`131005951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005951`
原始查询	`LOC131005951`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818574]; symbol=AT2G39870; hit=AT2G39870; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818574]; symbol=AT2G39870; hit=AT2G39870; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G39870` (AT2G39870) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818574] identity=25.8; qcov=1.07; evalue=1.12e-11; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27723 (UCP022260)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789059.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789059.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057789059.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789059.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72613858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:72613876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72613891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:72613905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:72613924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B117,B25
`Chr1:72614130`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B103,B134,B16,B49,B69,C42,C63,C67
`Chr1:72614146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B134,B16,B69
`Chr1:72615011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:72615021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C72
`Chr1:72615045`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A10,A13,A2,A21,A23,A24,A25,B105,B107,B120,B123,B124,B126,B137,B17,B27,B28,B40,B51,B52,B53,B62,B80,B83,C18,C20,C3,C42,C55,C57,C6,C61,C62,C80,D1,D2,D7
`Chr1:72615071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:72615079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789059.1

336 aa

168

336

UCP022260

PF27723 UCP022260 4-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789059.1`	Pfam	`PF27723`	UCP022260	Family	4	133	9e-15	55.3	Uncharacterised conserved protein UCP022260

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933076.1
AGGCCTTTGTCTCCCTCAACATTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTAAACAATTCTCTTTCCCATCTTCCTTGTAGAAACTGGGACCCTCTCTGCTCACAAAATACTCATTCCCATATACCGCCTCATTATTATATCTTCTTCAAGCAGCAACCTATTCACTCAAAACACTCAACTCTCACTCACTTTCTCTTCACTCTCTCACTCACTCACTCTCTCTCTCTCTCTTTTCAAACAATTAACATGGCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005951
ATGGCAGGTACCGCCGAAGGAGCTGGCTTCTGGCTGCCCTCCGAGTTCCTAGACGACTTCCTCGTCGACAAAGAAAATCTCAATCTCACTGAGTCCGACTCCGAGTTCCGCTTCCCCAACGAGTTCCCTTACGATTTCGGAACTAAAAGCGACGAGCTTCTCGAGTTTTCGCAGAAGCGGTGGGTGATGTCGACGTCGCCGCAGTCGACGCTGTCGCGCATGAGCAGCTGGACGGGGCGGAGCGCCGGCGGGTCGACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789059.1
MAGTAEGAGFWLPSEFLDDFLVDKENLNLTESDSEFRFPNEFPYDFGTKSDELLEFSQKRWVMSTSPQSTLSRMSSWTGRSAGGSTNGSPNGFPSPPTTPKNDAVGDLIYLAAGQVAKLKLAAGPTKHKGLVGPPRAPDHLYPAAKTPDPSLVHSIYLQQQMAKQQKQGCEMWPQMYQMRTGQDAWPVQPNPARVPGPGGRAAVYGGGGGAAVKRGCAGTGVFLPRRYGNNNNININNNNIIINNNNGCNAYASDSRKKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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