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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005538`

染色体: Chr01 坐标: 72220132-72223376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005538`
名称	SmilChr01G005538
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g11320
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72220132 - 72223376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005959`
GeneID	`131005959`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005959`
原始查询	`LOC131005959`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g11320
产物	probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g11320
Arabidopsis	`AT3G11320` (AT3G11320) Nucleotide-sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820304] identity=90.3; qcov=0.854; evalue=9.91e-173; confidence=high
Rice	`Os03g0286300` - identity=83.2; qcov=0.85; evalue=5.96e-162; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015297 (antiporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03151 (TPT); PF08449 (UAA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005959

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057789070.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789071.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789070.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789070.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72221791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B91
`Chr1:72222078`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B59,B7,C47,C74
`Chr1:72222078`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B59,B7,C47,C74
`Chr1:72222089`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B1,B59,B7,C47,C5,C74
`Chr1:72222092`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	83	A1,A13,A18,A20,A25,A6,A8,B1,B104,B105,B108,B110,B111,B113,B120,B125,B13,B133,B134,B135,B138,B139,B16,B22,B29,B3,B31,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B40,B41,B44,B45,B5,B59,B6,B60,B62,B68,B70,B75,B77,B8,B87,B88,B89,B90,B96,B98,C12,C17,C18,C21,C24,C25,C3,C30,C34,C35,C38,C39,C43,C44,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C6,C63,C67,C74,C76,C77,C81,C84,D3,D5
`Chr1:72222095`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr1:72222095`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr1:72222125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789070.1

309 aa

154

309

TPT

UAA

PF03151 TPT 15-302 aa PF08449 UAA 29-304 aa

XP_057789071.1

301 aa

150

301

TPT

PF03151 TPT 15-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789070.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	15	302	2.4e-46	159.1	Triose-phosphate Transporter family
`XP_057789070.1`	Pfam	`PF08449`	UAA	Family	29	304	9e-15	55.3	UAA transporter family
`XP_057789071.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	15	260	8.1e-35	121.3	Triose-phosphate Transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933087.1
ATTAATGTTCATAATTATTCGTAATTAATCAAATTAATAAACCCTCTCCAAACCAAATTCTTCGTCGGTCATCTTCACACCTCCAGAAACACGCACACCACGCGAAATTTCTCTCCTTTTTTTCTGCTCTCTTCAGCAATTAAGCATTTATGCGAGGTTTAAGCTTCATGATTTTTTGAGCTCTTTTTGAATTATTTTTTCTGTGTTGACGATTTGTGCCGAATCTGAGCCGTTGAATTTGACGATTCCACCACCAATGC...

XM_057933088.1
ATTAATGTTCATAATTATTCGTAATTAATCAAATTAATAAACCCTCTCCAAACCAAATTCTTCGTCGGTCATCTTCACACCTCCAGAAACACGCACACCACGCGAAATTTCTCTCCTTTTTTTCTGCTCTCTTCAGCAATTAAGCATTTATGCGAGGTTTAAGCTTCATGATTTTTTGAGCTCTTTTTGAATTATTTTTTCTGTGTTGACGATTTGTGCCGAATCTGAGCCGTTGAATTTGACGATTCCACCACCAATGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005959
ATGGTGGCGGCGAAATCTCAGGGGCGGCTGTTCACGATCGGGCTGGTGGCGTCGTGGTACTCGTCGAACATTGGGGTTTTGCTGCTGAACAAGTATTTGCTGAGCAATTACGGGTTCAAGTACCCGATTTTCTTGACGATGTGCCACATGACGGCGTGCTCGTTGCTCAGCTACATCGCGATCGCGTGGATGAAGATGGTGCCGATGCAGACGATAAGATCTAGGGTTCAGTTCATGAAGATCTCGGCGCTCAGCTTGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789070.1
MVAAKSQGRLFTIGLVASWYSSNIGVLLLNKYLLSNYGFKYPIFLTMCHMTACSLLSYIAIAWMKMVPMQTIRSRVQFMKISALSLIFCASVVSGNISLKYLPVSFNQAIGATTPFFTAVFAYLMTLKREAWLTYFTLVPVVTGVVIASGGEPSFHLFGFIMCIGATAARALKSVVQGILLSSEGEKLNSMNLLLYMAPIAVVLLLPVTLLMEENVVGITLALAREDFRIIWLLLFNSALAYFVNLTNFLVTKHTSALTL...

XP_057789071.1
MVAAKSQGRLFTIGLVASWYSSNIGVLLLNKYLLSNYGFKYPIFLTMCHMTACSLLSYIAIAWMKMVPMQTIRSRVQFMKISALSLIFCASVVSGNISLKYLPVSFNQAIGATTPFFTAVFAYLMTLKREAWLTYFTLVPVVTGVVIASGGEPSFHLFGFIMCIGATAARALKSVVQGILLSSEGEKLNSMNLLLYMAPIAVVLLLPVTLLMEENVVGITLALAREDFRIIWLLLFNSALAYFVNLTNFLVTKHTSALTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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