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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005707`

染色体: Chr01 坐标: 73305271-73306354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005707`
名称	SmilChr01G005707
描述	uncharacterized SmilChr01G005707
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73305271 - 73306354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005975`
GeneID	`131005975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005975`
原始查询	`LOC131005975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0459300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0459300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G55420` (AT3G55420) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824708] identity=68.5; qcov=0.732; evalue=4.2e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0459300` - identity=71.3; qcov=0.714; evalue=2.41e-99; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25236 (DUF7851)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789099.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789099.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789099.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789099.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73305360`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A5,B105,B133,B21,B29,C34
`Chr1:73305409`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	99	A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A4,A5,A9,B1,B10,B101,B103,B107,B115,B119,B12,B120,B123,B124,B125,B130,B18,B19,B21,B23,B28,B29,B31,B32,B33,B34,B36,B39,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B58,B61,B62,B63,B67,B72,B73,B76,B78,B83,B85,B88,B9,B95,B97,B98,B99,C1,C15,C16,C17,C19,C23,C26,C27,C29,C3,C32,C34,C39,C4,C43,C45,C46,C49,C5,C52,C54,C59,C6,C61,C63,C7,C72,C8,C80,C81,C87,D1,D10,D3,D5,D6,D8
`Chr1:73305422`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,A13,A14,A2,A20,A22,B110,B120,B124,B23,B3,B31,B33,B63,B97,B98,C29,C52,C59,C61,C62,C63,C87,D1,D8
`Chr1:73305431`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A15,B121,B42,B43,B47,B58,B62,B75,B80,B91,C10,C23,C3,C39,C4,C6
`Chr1:73305436`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	62	A10,A2,A21,B104,B114,B120,B122,B124,B128,B13,B131,B133,B136,B137,B139,B14,B15,B16,B19,B22,B23,B35,B45,B48,B51,B52,B53,B56,B66,B70,B76,B8,B80,B85,B86,B91,B93,B98,C13,C20,C21,C31,C34,C36,C41,C42,C48,C51,C56,C6,C64,C65,C68,C77,C78,C83,C85,C86,C87,D10,D2,D9
`Chr1:73305508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C4
`Chr1:73305509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:73305647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B113,B24,C1
`Chr1:73305755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:73305788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:73305818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:73305843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B35,B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789099.1

269 aa

134

269

DUF7851

PF25236 DUF7851 79-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789099.1`	Pfam	`PF25236`	DUF7851	Domain	79	259	5.8e-103	343.6	Domain of unknown function (DUF7851)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933116.1
TGTAACCTAAAAAAATAATTAAATCAGCATAGTTAGGAAATATTCATTAAAATCCATAAATGAAAGTTATATCGTCGGCACAGTTTATTGCCAAAGATCTGTTATCACTCTCATCAATCATCACTTTTCATCTTCCTCCAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAATCACCACATTTCATCACTTCTCCCACCCCTCCGCCGCCGCCCGCCGCCGCCTCATGGAAGAGAAAAAATCCAAAAGCAACAAAAATAAGAAGCCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005975
ATGAAAGTTATATCGTCGGCACAGTTTATTGCCAAAGATCTGTTATCACTCTCATCAATCATCACTTTTCATCTTCCTCCAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAATCACCACATTTCATCACTTCTCCCACCCCTCCGCCGCCGCCCGCCGCCGCCTCATGGAAGAGAAAAAATCCAAAAGCAACAAAAATAAGAAGCCGAAGCACCAGCACCCCAACGACCAGACCGCCGCCGCCAAAACCGACCTCTCCTTCAAGCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789099.1
MKVISSAQFIAKDLLSLSSIITFHLPPKTKNKKKITTFHHFSHPSAAARRRLMEEKKSKSNKNKKPKHQHPNDQTAAAKTDLSFKPSADVKGLRFGGQFIVKSFTVRRARPLELLRLLALPPARAAFASAAAYLPTNFTILAHRAWHTLTLGLGTRKSKVVVFVFESEAMRAAVERLWPAEIPLGEVNRKLIRGLAGCEMARFKFRKGCVTFYVYAVRRIGDLGFVCAEDLRSVLQAVVALKDFIDHTAMLALPEQRSIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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