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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005667`

染色体: Chr01 坐标: 72969955-72972116 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005667`
名称	SmilChr01G005667
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72969955 - 72972116 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005979`
GeneID	`131005979`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005979`
原始查询	`LOC131005979`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT4G00905` (AT4G00905) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827986] identity=54.7; qcov=0.924; evalue=1.22e-91; confidence=high
Rice	`Os09g0526800` (OJ1439_F07.19-1) - identity=52.6; qcov=1.02; evalue=1.32e-97; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005979

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057789103.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057789103.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789103.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789103.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72970094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:72970105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:72970159`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C85
`Chr1:72970159`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr1:72971330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:72971333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B94,D5
`Chr1:72971383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A7,B124,B4,C61
`Chr1:72971438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:72971450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:72971533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C11,C69
`Chr1:72971569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B104
`Chr1:72971624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789103.1

263 aa

132

263

LRAT

PF04970 LRAT 13-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789103.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	13	164	2.8e-28	99.3	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933120.1
TCTTGGAATAAAATTGCGAGTGTATACATATATGTATCTAATCGGAAACTGAAGCCAAGGAGAAAATGACGAATCTAATTTTGTTAATGGGGAAAAAAATTTAGAGAGAGAGGGAGGGAGAGATGGGATTTCTGTCACACAGAGTGAAACGAAGCGATTTAGAAGCAGGAGACCATATCTACACTTGGAGGACTCCCGTTTTCGCATACTCTCACCATGGTATCTATATTGGTGGTGACAAAGTGGTGCACTTCACTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005979
ATGGGATTTCTGTCACACAGAGTGAAACGAAGCGATTTAGAAGCAGGAGACCATATCTACACTTGGAGGACTCCCGTTTTCGCATACTCTCACCATGGTATCTATATTGGTGGTGACAAAGTGGTGCACTTCACTCAACATCAGAATTTGAGTTCTGGTGACTCTACTTCCTTTCGCTTCTCATCATCGATCACAGATGTCACAGCCGACTGTTTAGATTTTCCAGATTGCGGCTTCAGAAAGCATACAAGTGGAGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789103.1
MGFLSHRVKRSDLEAGDHIYTWRTPVFAYSHHGIYIGGDKVVHFTQHQNLSSGDSTSFRFSSSITDVTADCLDFPDCGFRKHTSGVVMSCLNCFLGDGSLYRFEYGVSPVVLITRLRSGTCTTAKSDPPEDVIHRAMHLLQHGFGKYDVFSNNCEDFALYCKTELVVCTQRGSGGSGQVSSVVGVPVAAILSLPLKMFVSNPVVLGATAVVSYNLNRYASDVGVRDDVVKVNVEGVAAFHGKLLAEVDGGADVAGDRRKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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