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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005628`

染色体: Chr01 坐标: 72738344-72740358 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005628`
名称	SmilChr01G005628
描述	uncharacterized protein At2g39795, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72738344 - 72740358 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005983`
GeneID	`131005983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005983`
原始查询	`LOC131005983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818565]; symbol=AT2G39795; hit=AT2G39795; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818565]; symbol=AT2G39795; hit=AT2G39795; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39795` (AT2G39795) Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818565] identity=47.4; qcov=0.969; evalue=3.34e-64; confidence=high
Rice	`Os01g0143300` - identity=53.2; qcov=0.804; evalue=5.31e-64; confidence=high
GO	GO:0005759 (mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF02330 (MAM33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789108.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057789108.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789108.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789108.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72738658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B124
`Chr1:72738677`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A25
`Chr1:72738677`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A25
`Chr1:72738937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D9
`Chr1:72738974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:72739018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:72739025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:72739085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,D6
`Chr1:72739223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B98,D5
`Chr1:72739232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B127,D9
`Chr1:72740042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C87
`Chr1:72740183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789108.1

255 aa

128

255

MAM33

PF02330 MAM33 74-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789108.1`	Pfam	`PF02330`	MAM33	Domain	74	253	2.2e-51	175.5	Mitochondrial glycoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933125.1
AGAAAAAAATTAATGCCAACCATATCCCAACAAAACCCTAGCATCCTAAAACCCTCGATAAAAGCCTCTGCTTCTCTCACTTCACAAAACCCTCATTTCTCCTTCTCTCTCCATCTCCACGAAAAATGGCCCTAAACAACGTGATACGCAGAGCTTCGAGAGTCGTACCTTTGGCCATTAGGGCTTCCGCCGGAAGTCAGAGGTACCTGCACAACCACCGCCAAGGCGCAGCCGTTCTCGCCGCCGTCAATCAACCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005983
ATGGCCCTAAACAACGTGATACGCAGAGCTTCGAGAGTCGTACCTTTGGCCATTAGGGCTTCCGCCGGAAGTCAGAGGTACCTGCACAACCACCGCCAAGGCGCAGCCGTTCTCGCCGCCGTCAATCAACCTTCACGCAATTTCTCACCGAGGGTATTTTCGTCGGTCGCTGTCCACCATTCCAACAAGCCCAAATCGGACGAGTCGCTCCTCCGAGTTCTCAAGTCCGAGCTTACGTGTGCTATCGAGAGTCAGACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789108.1
MALNNVIRRASRVVPLAIRASAGSQRYLHNHRQGAAVLAAVNQPSRNFSPRVFSSVAVHHSNKPKSDESLLRVLKSELTCAIESQTEEEIEIPEAFPFQIEDQPGQQTITLIREYNGEKISVEVQMPELAGDDENEKEDDDEDDQQAITESLLPIVVKISKPNAPSLEFSCTASADDITIDSLSIKDPEVSEDQIAYEGPDFGDLDENLQKAFHKYLEIRGIKPSTTNFLHEYMMDKDNREYVGWLENLKKFVEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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