当前解析结果
SmilChr01G005759| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005759 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005759 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005759 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 73682109 - 73697991 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005987 |
|---|---|
| GeneID | 131005987 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005987 |
| 原始查询 | LOC131005987 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005987 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057789117.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057789121.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057789117.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789117.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789117.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:73696834 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B63,C56 |
Chr1:73696963 |
ATC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B117,B28,C36,C40,C86 |
Chr1:73696963 |
ATC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B117,B28,C36,C40,C86 |
Chr1:73697223 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A16,B54,C63 |
Chr1:73697223 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A16,B54,C63 |
Chr1:73697242 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 103 | A11,A14,A21,A23,A25,A7,B101,B102,B106,B108,B109,B11,B113,B114,B115,B118,B120,B129,B130,B134,B136,B17,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B30,B31,B33,B34,B37,B38,B39,B41,B45,B46,B47,B51,B57,B58,B60,B63,B64,B67,B68,B69,B7,B71,B74,B75,B76,B77,B8,B80,B81,B85,B86,B87,B91,B94,B98,B99,C1,C17,C18,C2,C21,C22,C28,C3,C30,C31,C35,C37,C38,C41,C44,C45,C46,C48,C55,C57,C60,C61,C62,C67,C7,C71,C74,C75,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C9,D1,D5,D6,D9 |
Chr1:73697254 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B105,B122,B128,B140,B55,B73,B97,C10,C67,D8 |
Chr1:73697430 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B100,B117,B12,B49,B55,B9 |
Chr1:73697445 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,B24,C38 |
Chr1:73697466 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B76,B82,C33,C53,D4 |
Chr1:73697470 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C48,C72,D2 |
Chr1:73697499 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 103 | A1,A10,A11,A14,A15,A21,A7,A9,B102,B104,B105,B109,B110,B114,B119,B12,B120,B122,B123,B127,B128,B132,B134,B136,B14,B140,B16,B17,B19,B21,B24,B27,B29,B32,B34,B37,B4,B41,B44,B51,B55,B56,B58,B59,B6,B66,B71,B72,B73,B76,B79,B80,B83,B87,B90,B92,B93,B94,B97,C10,C11,C16,C21,C23,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C33,C34,C35,C38,C39,C41,C45,C47,C48,C49,C52,C53,C54,C56,C62,C64,C66,C69,C7,C72,C74,C75,C77,C79,C8,C81,C82,C84,C87,D10,D2,D3,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
14 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。