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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005646`

染色体: Chr01 坐标: 72865901-72867240 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005646`
名称	SmilChr01G005646
描述	uncharacterized SmilChr01G005646
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72865901 - 72867240 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005989`
GeneID	`131005989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005989`
原始查询	`LOC131005989`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820521]; symbol=AT3G13230; hit=AT3G13230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820521]; symbol=AT3G13230; hit=AT3G13230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G13230` (AT3G13230) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820521] identity=77; qcov=0.991; evalue=2.72e-123; confidence=high
Rice	`Os03g0115200` - identity=80.7; qcov=0.916; evalue=1.33e-119; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF22891 (KH_PNO1_2nd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789124.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057789124.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789124.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789124.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72866537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,A7,B88
`Chr1:72866660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B102,B65,B73,C47
`Chr1:72866679`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A7,B10,B102,B106,B11,B115,B119,B129,B15,B20,B22,B43,B51,B58,B89,B97,C18,C2,C28,C31,C32,C44,C56,C65,C68,C87,D6,D7
`Chr1:72866681`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A7,B10,B102,B106,B11,B115,B119,B129,B15,B20,B22,B43,B51,B58,B89,B97,C18,C2,C28,C31,C32,C44,C56,C65,C68,C87,D6,D7
`Chr1:72866711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B124
`Chr1:72866909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B23,C22,C51
`Chr1:72867080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789124.1

215 aa

108

215

KH_PNO1_2nd

PF22891 KH_PNO1_2nd 125-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789124.1`	Pfam	`PF22891`	KH_PNO1_2nd	Domain	125	208	2.7e-35	120.8	Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933141.1
ACTTTTTTTAAATTTTAAAATCTCATTCGGTCCCTCCCATCTCTAACTTTCTAACCCTAATTCCTCAAACTTCATCTCTCCCACACTCCAGCCGCCACGCGCAGGACTCCAGTTTTCCTCTGCGGCCTGCGTGTCCGACTCTATCAAAACCTTCACGCTTCAATCGGTTCCAGCTCTCGCCACCAGAGTCACCACCTTCACGCGATCATAGGCTTTCTTTTTATTATCGCATTGCTCGACTACAGAGAGCTAATATCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005989
ATGGATGTCGAAGCCGCAGCCGCTCCGCCGCAGAAGCCTACGGTTCTATTCGCACAGAAACCGAACTTCCGGCCTCTGAAGGCGCACGAAATCTCCGACGGTCAGATCCAGTTCCGCAAAATCTCGGTGCCGCCGCACCGCTACACGCCTCTTAAAAAAGCGTGGCTCGAGATCTACACCCCGATCTACGAGGAGATGAGAATCGACATCCGGATGAACCTCAAGGCGCGCAGGGTCGAGCTCAAGACCCGCCCCGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789124.1
MDVEAAAAPPQKPTVLFAQKPNFRPLKAHEISDGQIQFRKISVPPHRYTPLKKAWLEIYTPIYEEMRIDIRMNLKARRVELKTRPDTPDASSLQKCADFVHAFMLGFDVVDAVAMLRMDELYVGSFEIKDVKTLKGEHLSRAIGRLSGKGGKTKFAIENSTRTRIVIADSKIHMLGSFANIKVARDSLCSLILGSPAAKVYSKLRAVTARLAERF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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