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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005559`

染色体: Chr01 坐标: 72406073-72408999 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005559`
名称	SmilChr01G005559
描述	uncharacterized SmilChr01G005559
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72406073 - 72408999 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005990`
GeneID	`131005990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005990`
原始查询	`LOC131005990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468]; symbol=AT5G05830; hit=AT5G05830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468]; symbol=AT5G05830; hit=AT5G05830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05830` (AT5G05830) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468] identity=65.5; qcov=0.789; evalue=6.42e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0850200` (OsRFPV-3) - identity=61.1; qcov=0.761; evalue=5.85e-64; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789125.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789125.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789125.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789125.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72406308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:72406331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B33,C25,C3
`Chr1:72406463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C45
`Chr1:72406466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B82,D11
`Chr1:72408139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:72408181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C2,C20,C4
`Chr1:72408219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B28,C80
`Chr1:72408368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B44,C10,C21
`Chr1:72408372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789125.1

213 aa

106

213

RINGv

PF12906 RINGv 85-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789125.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	85	136	5.4e-10	40.0	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933142.1
AAACGAGCATAGCTCCATTTCCATATCTATATTCTATAGTCCAACAACCAAGGTCACTTTTCTTCTCCATTAAAATCCAACATATGCAAATCACATGTCCAATTACGTGTACACACAAATATGTCATCAAATTTCACATGTCTGCGGCAGCTGTAAGATACTTTTTGTGAGCAATTTATGTCGAAATTTTTTGGATAAAAGCTTTGCAAAATATCCCAGCAAAAAAGAGGGCGAGAGGCCAATGGTTATCCCCGCCACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005990
ATGTCATCTTTACAGCAATCGAGTGATGTTGATTTGGAATCAGGCGGTGGCGGTGGTGGTCCGGCGGAAGTAGCCGCCGGGAGAGGAGGTGGTGCTGCGCCTGCGCCGCCCTCTAATGGAAATGAGATTGTGAATGTGAAGGATAAGGTTGAGAGGAGGGATTCAAATGTTTCAGAGTATTCAGTGGAGATGGTGGATCTGGAATCTGGTGCAGATGAATCTAAGCTGCATTTGGCAAGAAATGTGAAGGATTGTAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789125.1
MSSLQQSSDVDLESGGGGGGPAEVAAGRGGGAAPAPPSNGNEIVNVKDKVERRDSNVSEYSVEMVDLESGADESKLHLARNVKDCRICHLSMDATNQESGIPIELGCSCKDDLAASHKQCAEAWFKIKGNKICEICGSIAQNVVGIDEAELMEQWNETNEADAAAAAAASATTRAPLLESRNFWQGHRFLNFLLACMVFAFVISWLFHFNVPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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