当前解析结果
SmilChr01G005691| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005691 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005691 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005691 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 73186048 - 73187309 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006004 |
|---|---|
| GeneID | 131006004 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006004 |
| 原始查询 | LOC131006004 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006004 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789139.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057789139.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789139.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789139.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789139.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:73186252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A18,B108,B35 |
Chr1:73186252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B108,B35 |
Chr1:73186870 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B29,B37,C44 |
Chr1:73186883 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr1:73186920 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr1:73186956 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr1:73186971 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B25,B3,C36 |
Chr1:73186972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B45,C63,C67 |
Chr1:73186987 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr1:73186988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr1:73186995 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,B28,B80 |
Chr1:73186999 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B45,C63,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。