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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005525`

染色体: Chr01 坐标: 72125207-72127564 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005525`
名称	SmilChr01G005525
描述	uncharacterized SmilChr01G005525
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72125207 - 72127564 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006034`
GeneID	`131006034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006034`
原始查询	`LOC131006034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0331900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0331900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G37975` (AT2G37975) Yos1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818375] identity=62.8; qcov=1.01; evalue=2.62e-31; confidence=medium
Rice	`Os03g0331900` - identity=69.2; qcov=1.01; evalue=6.26e-32; confidence=medium
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030134 (COPII-coated ER to Golgi transport vesicle)
KEGG	-
Pfam	PF08571 (Yos1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057789176.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057789176.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057789176.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789176.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72126292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:72126328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B117,B24,C48
`Chr1:72126379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:72126412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789176.1

77 aa

Yos1

PF08571 Yos1 3-77 aa

XP_057789177.1

77 aa

Yos1

PF08571 Yos1 3-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789176.1`	Pfam	`PF08571`	Yos1	Family	3	77	1.4e-24	86.9	Yos1-like
`XP_057789177.1`	Pfam	`PF08571`	Yos1	Family	3	77	1.4e-24	86.9	Yos1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933194.1
TGAAAATGAAAACGAAGTTAAAAGCCGTTGTTCCTGGCGACCTCAATCAAGACTTCTCCACCAGCACCGATCTGCCTATTTTTCTTAGTTTTGTGATCAATCCCCATTTTTTTCTTCTCGAACCCTTTAACTCTATGCTGTTTTTCTCGGAATGGGGTTGTGGACACTTCTAGAAGGCTGCCTGCTTCTTGCAAACGCCCTGGCCATATTAAATGAAGATCGGTTCCTTGCCCCTAGAGGATGGAGCTTCCAGGAGTATT...

XM_057933193.1
AAAATGAAAACGAAGTTAAAAGCCGTTGTTCCTGGCGACCTCAATCAAGACTTCTCCACCAGCACCGATCTGCCTATTTTTCTTAGTTTTGTGATCAATCCCCATTTTTTTCTTCTCGAACCCTTTAACTCTATGCTGTTTTTCTCGGAATGGGGTTGTGGACACTTCTAGAAGGCTGCCTGCTTCTTGCAAACGCCCTGGCCATATTAAATGAAGATCGGTTCCTTGCCCCTAGAGGATGGAGCTTCCAGGAGTATTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006034
ATGGGGTTGTGGACACTTCTAGAAGGCTGCCTGCTTCTTGCAAACGCCCTGGCCATATTAAATGAAGATCGGTTCCTTGCCCCTAGAGGATGGAGCTTCCAGGAGTATTCTGGGATTAAGAGAAACTCGTTCAAGGGACAGATACTTGGTCTTATCTACGCAACTCAGTACTTGAGAGTGCCCCTTATACTTCTAAATTTGCTCTGCGTCATTGTGAAGATGGTATCAGGGTGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789176.1
MGLWTLLEGCLLLANALAILNEDRFLAPRGWSFQEYSGIKRNSFKGQILGLIYATQYLRVPLILLNLLCVIVKMVSG

XP_057789177.1
MGLWTLLEGCLLLANALAILNEDRFLAPRGWSFQEYSGIKRNSFKGQILGLIYATQYLRVPLILLNLLCVIVKMVSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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