当前解析结果
SmilChr01G005708| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005708 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005708 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005708 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 73315538 - 73316278 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006036 |
|---|---|
| GeneID | 131006036 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006036 |
| 原始查询 | LOC131006036 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hexose transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818535]; symbol=AT2G39500; hit=AT2G39500; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | hexose transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818535]; symbol=AT2G39500; hit=AT2G39500; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G39500 (AT2G39500)hexose transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818535] identity=64.2; qcov=0.841; evalue=1.54e-21; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006036 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057789179.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057789179.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.40000 | XP_057789179.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789179.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789179.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:73315845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr1:73315976 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B94 |
Chr1:73315976 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr1:73316022 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B128,B52,C10,C15,C35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。