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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005529`

染色体: Chr01 坐标: 72149820-72153033 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005529`
名称	SmilChr01G005529
描述	uncharacterized SmilChr01G005529
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72149820 - 72153033 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006038`
GeneID	`131006038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006038`
原始查询	`LOC131006038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U2 small nuclear ribonucleoprotein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817576]; symbol=U2B''; hit=AT2G30260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	U2 small nuclear ribonucleoprotein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817576]; symbol=U2B''; hit=AT2G30260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G30260` (U2B'') U2 small nuclear ribonucleoprotein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817576] identity=67.3; qcov=0.502; evalue=3.05e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0298800` - identity=60.4; qcov=0.484; evalue=1.08e-31; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789182.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789182.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057789182.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789182.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72150638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C13
`Chr1:72150647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B124,B128,B29,C15
`Chr1:72152710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:72152729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C6,D8
`Chr1:72152763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B89,C74
`Chr1:72152797`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B91,C44,C87
`Chr1:72152797`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B91,C44,C87
`Chr1:72152799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B54,B6,C27,C80
`Chr1:72152821`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,A14,B119,B12,B121,B140,B21,B23,B27,B37,B40,B49,B51,B59,B63,B78,B79,B90,B92,C19,C31,C33,C37,C46,C52,C54,C58,C70,C79,C85
`Chr1:72152883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A7,B3,B63,C37,C4,C50,C56,C71,C80
`Chr1:72152900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C28,C7
`Chr1:72152914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933199.1
ATTAATGGTGAACCCTACCGCCTCCAGCCACCCCACCGCCGTCCACTGCCTTCACCGTTCACCGTCCTCCGCCTCCTCCGGCTATTGCCGCTGAGAAACACCTTCGCAGCCCGCGCCGTCAGCCTCTACCTCCGCAACGTCTGCAATCTACAATTCAAGGCCAGGGGATCTACGAGAAGAAGAACCGAAAGCGAAGAAGAACCGAAAGCGCCCCTCCGCCGCCGCCGCCGCAGCCTATTCCGTTCAATTTCTGTCCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006038
ATTAATGGTGAACCCTACCGCCTCCAGCCACCCCACCGCCGTCCACTGCCTTCACCGTTCACCGTCCTCCGCCTCCTCCGGCTATTGCCGCTGAGAAACACCTTCGCAGCCCGCGCCGTCAGCCTCTACCTCCGCAACGTCTGCAATCTACAATTCAAGGCCAGGGGATCTACGAGAAGAAGAACCGAAAGCGAAGAAGAACCGAAAGCGCCCCTCCGCCGCCGCCGCCGCAGCCTATTCCGTTCAATTTCTGTCCCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789182.1
INGEPYRLQPPHRRPLPSPFTVLRLLRLLPLRNTFAARAVSLYLRNVCNLQFKARGSTRRRTESEEEPKAPLRRRRRSLFRSISVPASNRHHRLGPPASSSAVAGPSLTPLQNPLQYGRILDVVALKTPKLRGQAWVVFSEVTAASNAVRQMQNFQFYEKPLRIQYAKSKSDCIAKAEGTYDKKKKLEEKAERKKRVEEGQPAPAASGPRADSNGGPSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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