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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005767`

染色体: Chr01 坐标: 73755398-73759578 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005767`
名称	SmilChr01G005767
描述	peroxisome biogenesis protein 12
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73755398 - 73759578 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006069`
GeneID	`131006069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006069`
原始查询	`LOC131006069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisome biogenesis protein 12
产物	peroxisome biogenesis protein 12
Arabidopsis	`AT3G04460` (PEX12) peroxin-12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819602] identity=74; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0467200` - identity=73.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0006513 (protein monoubiquitination); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016558 (protein import into peroxisome matrix); GO:1990429 (peroxisomal importomer complex)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04757 (Pex2_Pex12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057789194.1`
2	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	1.00000	`XP_057789194.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789194.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789194.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73755524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:73756110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr1:73756380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C63
`Chr1:73756429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B52,C71
`Chr1:73757307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B74,B91,C6
`Chr1:73757913`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:73757913`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:73757937`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:73757937`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:73757948`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:73757948`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:73757960`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C20,C62,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789194.1

392 aa

196

392

Pex2_Pex12

PF04757 Pex2_Pex12 21-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789194.1`	Pfam	`PF04757`	Pex2_Pex12	Family	21	302	6.5e-42	144.4	Pex2 / Pex12 amino terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933211.1
AAACGAAGAGCACACATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGATGTTGTTTCAGGTGGGAGGGCAAGGAACGCGGCCGACATTCTTCGAGATGTCGGCCGCCCAGCAGCTGCCGTCAAGTGTACGCGCCGCTCTCACTTACTCACTCGGCGTATTTGCTCTGAGAAGACCCTTCATTCATAAAATTTTGGATTATGAAGATGAGTTTTTTGCGCTGCTTATGCTAGTCCTTGAAACTCACAGTTTGCGCACAACAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006069
ATGTTGTTTCAGGTGGGAGGGCAAGGAACGCGGCCGACATTCTTCGAGATGTCGGCCGCCCAGCAGCTGCCGTCAAGTGTACGCGCCGCTCTCACTTACTCACTCGGCGTATTTGCTCTGAGAAGACCCTTCATTCATAAAATTTTGGATTATGAAGATGAGTTTTTTGCGCTGCTTATGCTAGTCCTTGAAACTCACAGTTTGCGCACAACAGACGCTTCTTTTTCAGAATCTTTATATGGCTTAAGGAGGAGGGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789194.1
MLFQVGGQGTRPTFFEMSAAQQLPSSVRAALTYSLGVFALRRPFIHKILDYEDEFFALLMLVLETHSLRTTDASFSESLYGLRRRGVKIKLKKSNLLTNSADEVHHTGLHKRQKVLSVVFLVVLPYLKSKLQSTYNREREASLQASLWGDSDERFDDDYVSRGNNSFGPRDVSNVEASARARCVKRLRKIVGACYPWLHAGNEGLCFAYQLLYLLDATGFYSLGLHALGIHVCRATGQELMDTSSRISKIRSRERERLRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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