当前解析结果
SmilChr01G005768| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005768 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005768 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005768 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 73759549 - 73760858 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006071 |
|---|---|
| GeneID | 131006071 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006071 |
| 原始查询 | LOC131006071 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0007142 (male meiosis II) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006071 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057789195.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057789195.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057789195.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057789195.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789195.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:73759707 |
A |
ACC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 43 | A15,A21,A25,A4,A8,B101,B103,B114,B12,B122,B123,B13,B137,B17,B19,B21,B38,B39,B5,B51,B52,B55,B65,B70,B75,B84,B88,B89,B97,C10,C20,C33,C35,C50,C56,C57,C65,C71,C76,C80,C87,D2,D4 |
Chr1:73759741 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:73759749 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B7,C83 |
Chr1:73759757 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B109 |
Chr1:73759757 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr1:73759773 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B121,B74,B91,C6 |
Chr1:73759844 |
TGA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A19,A5,B46,B68,C2,C37,C53,C82 |
Chr1:73759848 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A19,A5,B46,B68,C2,C37,C53,C82 |
Chr1:73759883 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B101,B13,C71 |
Chr1:73759908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr1:73759937 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,B43 |
Chr1:73759958 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。