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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005769`

染色体: Chr01 坐标: 73768981-73771115 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005769`
名称	SmilChr01G005769
描述	uncharacterized SmilChr01G005769
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73768981 - 73771115 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006072`
GeneID	`131006072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006072`
原始查询	`LOC131006072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G54560; symbol=AT5G54560; hit=AT5G54560; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G54560; symbol=AT5G54560; hit=AT5G54560; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G54560` (AT5G54560) - identity=25.1; qcov=0.667; evalue=9.71e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057789196.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789196.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789196.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789196.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73769183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:73769320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:73769333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B54,B58,C63
`Chr1:73769357`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr1:73769357`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91
`Chr1:73769528`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C4,D10
`Chr1:73769528`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C4,D10
`Chr1:73769537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:73769557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C6
`Chr1:73769593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B25,B8,C78
`Chr1:73769624`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A15,A2,B1,B101,B103,B107,B108,B110,B111,B121,B124,B131,B31,B32,B33,B35,B60,B61,B62,B71,B76,B77,B78,B81,B89,B93,B94,B98,C11,C12,C17,C20,C23,C25,C44,C49,C51,C52,C58,C61,C62,C69,C70,C71,D1,D7
`Chr1:73769625`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A15,A2,B1,B101,B103,B107,B108,B110,B111,B121,B124,B131,B31,B32,B33,B35,B60,B61,B62,B71,B76,B77,B78,B81,B89,B93,B94,B98,C11,C12,C17,C20,C23,C25,C44,C49,C51,C52,C58,C61,C62,C69,C70,C71,D1,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789196.1

430 aa

215

430

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 91-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789196.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	91	389	1.7e-29	103.8	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933213.1
TTCCAAATAATAATATTTCTGACTAACAATCTAACAATATTACTTTGTTTTACTTTTCTCCCAAGCAAACTTCAAACAAATTCCATCTCTCCCAAGTGGAGAATTTGGGCCTAGCCTTATAGACATTATTAACTCAAACTTCTTACTAAGTCCGCCGCCGCTAGGGCAGACGTCTGAGCTACAACACATGGGTTCTTCCGCCGTCCTCCGCCGCTGGATCTCTAGCAGTGGAATTTCGAGATCTCGCAGCATTTCCTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006072
ATGGGTTCTTCCGCCGTCCTCCGCCGCTGGATCTCTAGCAGTGGAATTTCGAGATCTCGCAGCATTTCCTATTTCAGCAATTCAGCTGCAAATCGGATGATGAGCACGGCGGCCACGAGCGGCGGCGTTAGTTCACCGCCGGCGCCATGGCTGATGCTGCCACCGGCCGTCGATGAAAGCGGCGACCTAGCTTACAGATTCCAGAGCCTCGCAACGAAGGAGGAATTGATTCACAAAAACAAGATATCCAGCGATGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789196.1
MGSSAVLRRWISSSGISRSRSISYFSNSAANRMMSTAATSGGVSSPPAPWLMLPPAVDESGDLAYRFQSLATKEELIHKNKISSDELQLDELQLPAEIDLIKDVDFVGSSHGWLALYNRRSTDLFLSNPIADRHVKLPPLPGADRVILSASDAPLAFATFGSRRELAFCRPHRRGGEWTHFGGDYTYDNLVYSTKHKRLFCVCHEQEYYGINIILEGWDVDRIEERPPKLDWVIQGNDELNLADYRRDWPGRSEFKKECL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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