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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001616`

染色体: Chr01 坐标: 30278689-30280218 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001616`
名称	SmilChr01G001616
描述	uncharacterized SmilChr01G001616
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30278689 - 30280218 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006079`
GeneID	`131006079`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006079`
原始查询	`LOC131006079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0303800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0303800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=24.7; qcov=0.749; evalue=9.91e-10; confidence=weak
Rice	`Os11g0303800` - identity=26.7; qcov=0.727; evalue=2.06e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006079

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789208.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789208.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789208.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789208.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30278737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:30279621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C42
`Chr1:30279642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B87,C16,C49,D5
`Chr1:30279656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B4,C36,C69,D11
`Chr1:30279657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,C25,C36,C53,C80
`Chr1:30279663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A13,A6,B103,B115,B121,B126,B30,B31,B34,B63,B64,B67,B71,B80,B95,B98,C24,C30,C35,C42,C45,C46,C53,C6,C75,C83,D7
`Chr1:30279664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B13,B56,C43
`Chr1:30279665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B115,B63,C45,C83
`Chr1:30279674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B63,C45,C83
`Chr1:30279677`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B15,B25,B44,B47,B50,B6,B7,C11,C32
`Chr1:30279681`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B15,B25,B44,B47,B50,B6,B7,C11,C32
`Chr1:30279687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B39,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933225.1
ATGGATTGCGAATTCGATGAATACCTCGAGCAACAAGGCGGTTCGAGGCTTCCAATGATGGGATTTGCTCCATTTTCGCAAGCCTCCAATGTCTTGGCTACGGGAAATCTTCCCACGCCGGCGGCGAACGCCAACGTCCAAGAAGAGCCGGAGGCGTTGAGGCCGAAAGCCAAGGGCACCTGCGCTGCATATTCTAGCGAGGAGTCCGAGCTCGTGGCAATCTTGTGGGCGGAGGCAACCCACAATCCTATTTTGGGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006079
ATGGATTGCGAATTCGATGAATACCTCGAGCAACAAGGCGGTTCGAGGCTTCCAATGATGGGATTTGCTCCATTTTCGCAAGCCTCCAATGTCTTGGCTACGGGAAATCTTCCCACGCCGGCGGCGAACGCCAACGTCCAAGAAGAGCCGGAGGCGTTGAGGCCGAAAGCCAAGGGCACCTGCGCTGCATATTCTAGCGAGGAGTCCGAGCTCGTGGCAATCTTGTGGGCGGAGGCAACCCACAATCCTATTTTGGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789208.1
MDCEFDEYLEQQGGSRLPMMGFAPFSQASNVLATGNLPTPAANANVQEEPEALRPKAKGTCAAYSSEESELVAILWAEATHNPILGTSQRLLQYWGAIAEKFNALIESGAPPRKAEHLKSHFARVQKEMKFFEGFYNTCKENWGSGMSDDQITQQAQTMFEANFKKQFSYIKAWKVLRECERFMSQAGDVHSAKKLKGSDGGCARPIVPLSYPLCPCSRASYPSSPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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